14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6024 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6024  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5545  hypothetical protein  97.35 
 
 
189 aa  331  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000151722 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4899  hypothetical protein  80.45 
 
 
220 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.338147  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6142  hypothetical protein  57.85 
 
 
224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.551083  normal  0.349913 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5440  hypothetical protein  63.43 
 
 
135 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.983092  hitchhiker  0.0031733 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5676  hypothetical protein  26.87 
 
 
196 aa  62  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167511  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4730  putative SyrB-like regulator  58.82 
 
 
144 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5675  transposase IS3/IS911 family protein  74.36 
 
 
151 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.065322  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6244  transposase IS3/IS911 family protein  59.57 
 
 
151 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286208  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4606  SyrB2 regulator  45.77 
 
 
143 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.378272 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4604  hypothetical protein  29.82 
 
 
193 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74916  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4731  hypothetical protein  28.38 
 
 
189 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0141  SyrB family protein, putative  52.38 
 
 
145 aa  46.6  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6374  hypothetical protein  28.57 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>