9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5676 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5676  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6374  hypothetical protein  61.17 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4604  hypothetical protein  33.83 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74916  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4731  hypothetical protein  32.21 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6142  hypothetical protein  27.71 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.551083  normal  0.349913 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4899  hypothetical protein  30.04 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.338147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6024  hypothetical protein  25.75 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5674  hypothetical protein  27.59 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4605  hypothetical protein  52.78 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>