11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5674 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5674  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4605  hypothetical protein  46.08 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6023  hypothetical protein  35.21 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5544  hypothetical protein  32.04 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214376  hitchhiker  0.0000157551 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6141  hypothetical protein  32.04 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.416343  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4900  hypothetical protein  32.23 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5439  hypothetical protein  75 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184625 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5694  hypothetical protein  55.56 
 
 		 80 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4604  hypothetical protein  51.28 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74916  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6374  hypothetical protein  51.28 
 
 		 186 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5676  hypothetical protein  51.28 
 
 		 196 aa  41.6  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167511  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>