19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5621 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 
138 aa  263  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5260  nutrient deprivation-induced protein  67.39 
 
 
138 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3900  putative nutrient deprivation-induced protein  57.25 
 
 
139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0615251  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  39.72 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  33.58 
 
 
131 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  35.61 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  30.16 
 
 
132 aa  50.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  31.34 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  31.34 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  32 
 
 
120 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  30.3 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  34.78 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  27.61 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  29.77 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  30.34 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4599  hypothetical protein  29.5 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3869  hypothetical protein  27.41 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.748627  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1438  protein of unknown function DUF1469  28.47 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157465  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1891  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373064  normal  0.485358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>