187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1685 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1685  twin arginine translocase protein A  100 
 
 
64 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1487  twin arginine translocase protein A  98.41 
 
 
63 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2790  twin arginine translocase protein A  63.49 
 
 
79 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0371592  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1779  twin arginine translocase protein A  60.94 
 
 
78 aa  87.4  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00352153  hitchhiker  0.00879203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2745  twin arginine translocase protein A  63.49 
 
 
79 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2668  SEC-independent protein translocase protein  78.87 
 
 
71 aa  87.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.598915  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1788  twin arginine translocase protein A  61.9 
 
 
79 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2345  twin arginine translocase protein A  75.76 
 
 
76 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172341  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3708  twin arginine translocase protein A  71.43 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0454657  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3399  twin arginine translocase protein A  71.43 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1806  twin arginine translocase protein A  77.05 
 
 
71 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0839673  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2513  twin arginine translocase protein A  61.9 
 
 
78 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640298  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4417  twin arginine translocase protein A  65.08 
 
 
77 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1164  twin arginine translocase protein A  73.53 
 
 
68 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0248599  normal  0.16996 
 
 
-
 
NC_004310  BR0882  twin arginine translocase protein A  75.41 
 
 
80 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0873  twin arginine translocase protein A  75.41 
 
 
80 aa  84  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3590  twin arginine translocase protein A  70.37 
 
 
91 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.744358  normal  0.70676 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3189  twin arginine translocase protein A  58.73 
 
 
78 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2183  twin arginine translocase protein A  70.59 
 
 
90 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2485  twin arginine translocase protein A  72 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359725  normal  0.0181942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2764  twin arginine translocase protein A  74.47 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0594411  normal  0.122404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2705  twin arginine translocase protein A  53.03 
 
 
81 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0589  twin arginine translocase protein A  62.5 
 
 
82 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.905934 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1143  twin arginine translocase protein A  66.1 
 
 
77 aa  70.5  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  55.56 
 
 
71 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  55 
 
 
73 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2610  twin arginine-targeting protein translocase  48.33 
 
 
93 aa  67  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4407  twin arginine translocase protein A  76.6 
 
 
78 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1094  twin arginine-targeting protein translocase  56.25 
 
 
83 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1773  twin-arginine translocation protein TatA/E  71.15 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3930  twin arginine translocase protein A  69.39 
 
 
85 aa  63.5  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3549  twin arginine translocase protein A  55.1 
 
 
79 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475634  hitchhiker  0.000865371 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0339  twin arginine translocase protein A  47.06 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11873  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0744  twin arginine translocase protein A  44.26 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632356  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1053  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
87 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0781  twin arginine translocase protein A  44.26 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0308647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3534  twin arginine translocase protein A  44.12 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36939  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0116  twin arginine translocase protein A  45.59 
 
 
73 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2748  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
78 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665647  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3375  twin arginine translocase protein A  50.94 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0363  twin arginine translocase protein A  44.12 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0354  twin arginine translocase protein A  44.12 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  46.88 
 
 
77 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3119  twin arginine-targeting protein translocase  52.83 
 
 
74 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0514819  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2703  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3682  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.759225  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3250  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1799  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3655  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3713  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2754  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  55.32 
 
 
73 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3219  twin arginine translocase protein A  41.27 
 
 
85 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497525  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  41.27 
 
 
85 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0548189 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0115  twin arginine translocase protein A  53.06 
 
 
73 aa  57.4  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0814  twin arginine translocase protein A  53.33 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514575  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2671  twin arginine translocase protein A  42.65 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0436  twin arginine translocase protein A  42.65 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.510795  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0415  twin arginine translocase protein A  42.65 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00507108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1180  twin arginine translocase protein A  48 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0016  twin arginine-targeting protein translocase  43.33 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2982  twin arginine translocase protein A  48.98 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2942  twin arginine translocase protein A  47.06 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0409  twin arginine translocase protein A  48.98 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5554  twin arginine translocase protein A  53.33 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.80239  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0258  twin arginine translocase protein A  51.11 
 
 
72 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0612508  hitchhiker  0.00415205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1416  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  70.83 
 
 
88 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3760  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.67 
 
 
85 aa  54.3  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  43.06 
 
 
84 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0706  twin arginine translocase protein A  51.11 
 
 
84 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.121051  normal  0.444547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1343  Sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.98 
 
 
74 aa  53.5  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.139725 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  43.84 
 
 
89 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.84 
 
 
89 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  43.84 
 
 
89 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  43.84 
 
 
89 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  43.84 
 
 
89 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  43.84 
 
 
89 aa  52.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  43.84 
 
 
89 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  43.84 
 
 
89 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  43.84 
 
 
89 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4244  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.33 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3027  twin arginine-targeting protein translocase  63.41 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190632  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0542  twin arginine-targeting protein translocase  45.83 
 
 
54 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0152  mttA/Hcf106 family protein  44.44 
 
 
55 aa  51.2  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  53.19 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3912  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001924  twin-arginine translocation protein TatA  42.86 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1209  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.94 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00565  twin arginine translocase protein A  45 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3376  twin arginine-targeting protein translocase  37.68 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0852423  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2429  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0442  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.68 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0428  twin arginine-targeting protein translocase  37.68 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000041421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0472  twin arginine-targeting protein translocase  48.94 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0416  twin arginine-targeting protein translocase  37.68 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>