80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0317 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0317  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 
130 aa  267  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.763946  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0349  flagellar basal body rod protein FlgB  95.38 
 
 
130 aa  255  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0735  flagellar basal body rod protein FlgB  63.57 
 
 
130 aa  183  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0255  flagellar basal body rod protein FlgB  58.02 
 
 
126 aa  156  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4212  flagellar basal body rod protein FlgB  53.54 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0151  flagellar basal body rod protein FlgB  52.8 
 
 
126 aa  130  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0135  flagellar basal body rod protein FlgB  52 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0024  flagellar basal body rod protein FlgB  47.29 
 
 
126 aa  124  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1692  flagellar basal body rod protein FlgB  47.79 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315615  normal  0.0176326 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1144  flagellar basal body rod protein FlgB  44.96 
 
 
128 aa  116  7.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0298  flagellar basal body rod protein FlgB  43.41 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1094  flagellar basal body rod protein FlgB  43.41 
 
 
125 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3673  flagellar basal body rod protein FlgB  43.41 
 
 
127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0629  flagellar basal body rod protein FlgB  41.27 
 
 
129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0618  flagellar basal body rod protein FlgB  41.27 
 
 
129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0896138  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3656  flagellar basal body rod protein FlgB  40.31 
 
 
126 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.306825  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0596  flagellar basal body rod protein FlgB  39.68 
 
 
129 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.244257 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3437  putative flagellar basal-body rod protein FlgB  38.66 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5538  flagellar basal body rod protein FlgB  35 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5155  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 
133 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2826  flagellar basal-body rod protein FlgB  30 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2570  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.81 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2992  flagellar basal body rod protein FlgB  26.45 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4524  flagellar basal body rod protein  55.32 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.996777  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1331  flagellar basal body rod protein FlgB  27.73 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.754656  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2110  flagellar basal body rod protein FlgB  33.9 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.132503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5497  flagellar basal body rod protein FlgB  34.92 
 
 
135 aa  53.5  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0469396  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  35.05 
 
 
129 aa  53.5  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2965  flagellar basal body rod protein FlgB  29.66 
 
 
129 aa  51.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.157354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2831  flagellar basal body rod protein FlgB  32.26 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.159517 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.35 
 
 
137 aa  50.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.69 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.7 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1392  flagellar basal body rod protein FlgB  32.79 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154079  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2608  flagellar basal body rod protein FlgB  30.65 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0696754  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0300  flagellar basal body rod protein FlgB  28.93 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3583  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.01 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0676749  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2638  flagellar basal body rod protein FlgB  31.45 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2235  flagellar basal body rod protein FlgB  30.84 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  28.69 
 
 
130 aa  47.4  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1321  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.17 
 
 
134 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.59 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0058  flagellar basal body rod protein FlgB  29.63 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.372308  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.59 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.2 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4198  flagellar basal body rod protein FlgB  40.51 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.63 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.26 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02928  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0742693  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  30.33 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.89 
 
 
165 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2272  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.3 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.240352 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.68 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2600  flagellar basal body rod protein FlgB  25 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1674  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.25 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0693  flagellar basal body rod protein FlgB  31.68 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.09 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5625  flagellar basal body rod protein FlgB  29.77 
 
 
135 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.2 
 
 
144 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.93 
 
 
134 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1132  flagellar basal body rod protein FlgB  30.83 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1517  flagellar basal body rod protein FlgB  28.85 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0183705  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.67 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  42.42 
 
 
136 aa  40.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  30.91 
 
 
138 aa  40.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  31.5 
 
 
138 aa  40.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4411  flagellar basal body rod protein FlgB  31.86 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  30.91 
 
 
138 aa  40.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  30.91 
 
 
138 aa  40.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  30.91 
 
 
138 aa  40.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  30.91 
 
 
138 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.21 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  39.22 
 
 
132 aa  40.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.91 
 
 
138 aa  40.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  30.91 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  30.91 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  23.73 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.74 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0365  flagellar basal body rod protein FlgB  30.88 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  29.13 
 
 
138 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>