14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5268 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5268  hypothetical protein  100 
 
 
592 aa  1228    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44910  hypothetical protein  38.61 
 
 
569 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00907398  normal  0.870076 
 
 
-
 
NC_003296  RS01939  putative transmembrane protein  39.41 
 
 
497 aa  331  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0637  hypothetical protein  31.6 
 
 
644 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6903  hypothetical protein  30.8 
 
 
646 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05220  hypothetical protein  31.64 
 
 
612 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00396  hypothetical protein  31.44 
 
 
569 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0648901  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3171  hypothetical protein  28.31 
 
 
539 aa  147  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0116  hypothetical protein  37.66 
 
 
248 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215371  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0290  hypothetical protein  26.33 
 
 
685 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0081  hypothetical protein  34.81 
 
 
230 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.753199  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1241  hypothetical protein  34.81 
 
 
230 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1521  hypothetical protein  35.58 
 
 
206 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0097  hypothetical protein  35.58 
 
 
206 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>