17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3345 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3992  hypothetical protein  78.85 
 
 		 647 aa  870    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3345  hypothetical protein  100 
 
 		 664 aa  1303    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2913  hypothetical protein  42.42 
 
 		 661 aa  399  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1235  hypothetical protein  42.53 
 
 		 650 aa  381  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.767202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2408  hypothetical protein  26.85 
 
 		 526 aa  100  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1207  hypothetical protein  29.97 
 
 		 518 aa  91.7  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1075  hypothetical protein  23.34 
 
 		 744 aa  63.5  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0202284  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4240  hypothetical protein  28.62 
 
 		 502 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132494 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4443  hypothetical protein  22.63 
 
 		 518 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.315407 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4381  hypothetical protein  22.63 
 
 		 518 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0468  hypothetical protein  27.9 
 
 		 516 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.633748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0822  hypothetical protein  25.55 
 
 		 528 aa  57.4  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4942  hypothetical protein  30.3 
 
 		 499 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1738  hypothetical protein  27.05 
 
 		 578 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.568189  normal  0.233256 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3112  hypothetical protein  27.97 
 
 		 469 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3004  hypothetical protein  28.32 
 
 		 439 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.104415  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0449  hypothetical protein  32.46 
 
 		 509 aa  45.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.727643  normal  0.216605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>