More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0301 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 225 aa  464  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  90.71 
 
 		 226 aa  423  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  80.75 
 
 		 224 aa  354  5.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  64.68 
 
 		 206 aa  267  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  62.09 
 
 		 213 aa  232  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  59.69 
 
 		 239 aa  231  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  59.69 
 
 		 239 aa  231  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  61.2 
 
 		 212 aa  228  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  62.86 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  64.2 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  58.25 
 
 		 235 aa  224  9e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  57.14 
 
 		 199 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  62.5 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  60.23 
 
 		 202 aa  223  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  61.85 
 
 		 201 aa  223  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  59.89 
 
 		 218 aa  222  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  58.24 
 
 		 214 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  58.24 
 
 		 214 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  58.66 
 
 		 190 aa  222  4e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  59.22 
 
 		 216 aa  221  9e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  56.67 
 
 		 223 aa  221  9e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  52.34 
 
 		 219 aa  220  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  57.81 
 
 		 226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  57.87 
 
 		 190 aa  219  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  58.47 
 
 		 194 aa  218  6e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  59.88 
 
 		 179 aa  218  6e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 		 190 aa  217  1e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  57.78 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  57.69 
 
 		 220 aa  216  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  59.43 
 
 		 219 aa  215  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  54.84 
 
 		 213 aa  215  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  58.66 
 
 		 218 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  56.04 
 
 		 243 aa  214  5.9999999999999996e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  56.74 
 
 		 190 aa  214  7e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 		 190 aa  214  9e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  53.57 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  55.68 
 
 		 212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  55.68 
 
 		 212 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  55.06 
 
 		 195 aa  211  7e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21868  predicted protein  56.82 
 
 		 186 aa  211  9e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213311  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  55.87 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  56.04 
 
 		 216 aa  210  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  55.43 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  54.55 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  54.14 
 
 		 203 aa  208  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  54.44 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  54.55 
 
 		 211 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  56.57 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  56.18 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  55.43 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  54.55 
 
 		 209 aa  204  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  52.49 
 
 		 188 aa  204  9e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  57.87 
 
 		 190 aa  203  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  53.98 
 
 		 211 aa  203  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  53.98 
 
 		 211 aa  203  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  52.49 
 
 		 184 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  53.98 
 
 		 211 aa  203  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  53.98 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  57.4 
 
 		 195 aa  203  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  53.72 
 
 		 188 aa  202  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  50.54 
 
 		 203 aa  203  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  53.41 
 
 		 292 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1182  GTP cyclohydrolase I  56.82 
 
 		 187 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  53.41 
 
 		 242 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  53.41 
 
 		 292 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  53.41 
 
 		 258 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  53.41 
 
 		 292 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  53.41 
 
 		 292 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  53.41 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  53.41 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  53.41 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  54.44 
 
 		 198 aa  202  3e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  53.41 
 
 		 292 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0836  GTP cyclohydrolase I  53.57 
 
 		 214 aa  202  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0812961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  55.93 
 
 		 210 aa  202  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42850  GTP cyclohydrolase I  54.75 
 
 		 181 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3598  GTP cyclohydrolase I  54.75 
 
 		 181 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  53.55 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  54.4 
 
 		 206 aa  201  6e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  51.93 
 
 		 190 aa  201  7e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  51.65 
 
 		 185 aa  201  8e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2744  GTP cyclohydrolase I  55.68 
 
 		 181 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0752455  normal  0.719118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  52.51 
 
 		 206 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  53.89 
 
 		 181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  53.63 
 
 		 185 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 203 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  57.07 
 
 		 193 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  52.97 
 
 		 189 aa  199  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  53.33 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  56.47 
 
 		 198 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  0.00000626036 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  51.63 
 
 		 190 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  54.75 
 
 		 188 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  53.33 
 
 		 181 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2117  GTP cyclohydrolase I  53.55 
 
 		 203 aa  198  5e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  52.81 
 
 		 189 aa  198  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04920  GTP cyclohydrolase I, putative  53.37 
 
 		 435 aa  198  6e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  56 
 
 		 187 aa  198  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  56.67 
 
 		 257 aa  198  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  57.69 
 
 		 188 aa  198  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>