70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3274 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3274  allantoicase  100 
 
 		 336 aa  697    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3145  allantoicase  90.18 
 
 		 336 aa  640    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3472  allantoicase  90.77 
 
 		 336 aa  644    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.757583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1298  allantoicase  79.1 
 
 		 337 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2386  allantoicase  77.68 
 
 		 384 aa  564  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2327  allantoicase  78.81 
 
 		 337 aa  564  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.877765  normal  0.393654 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2069  allantoicase  78.87 
 
 		 337 aa  565  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2531  allantoicase  77.68 
 
 		 337 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0338515  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1505  allantoicase  77.68 
 
 		 337 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.59781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2005  allantoicase  77.68 
 
 		 337 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3305  allantoicase  77.68 
 
 		 337 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2430  allantoicase  77.68 
 
 		 384 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1277  allantoicase  77.68 
 
 		 337 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1949  allantoicase  78.27 
 
 		 337 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5276  allantoicase  78.27 
 
 		 337 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0422431 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1876  allantoicase  77.98 
 
 		 337 aa  557  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.667162  normal  0.0784409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1985  allantoicase  78.27 
 
 		 337 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.55948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1928  allantoicase  78.51 
 
 		 337 aa  560  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.701252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1961  allantoicase  77.98 
 
 		 337 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6116  allantoicase  77.98 
 
 		 337 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1309  allantoicase  77.08 
 
 		 337 aa  552  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.017957 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0569  allantoicase  75.52 
 
 		 336 aa  534  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2595  allantoicase  75 
 
 		 336 aa  531  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000409721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3387  allantoicase  75.22 
 
 		 336 aa  532  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117566 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1204  allantoicase  75.52 
 
 		 336 aa  525  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3457  allantoicase  74.33 
 
 		 357 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3733  allantoicase  75.08 
 
 		 335 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3459  allantoicase  74.63 
 
 		 336 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3422  allantoicase  74.03 
 
 		 357 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0252136  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0614  allantoicase  74.47 
 
 		 335 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0568  allantoicase  74.77 
 
 		 335 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276523 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2460  allantoicase  74.33 
 
 		 336 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2648  allantoicase  74.33 
 
 		 336 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0164  allantoicase  74.47 
 
 		 335 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.803249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1237  allantoicase  74.33 
 
 		 336 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0378  allantoicase  74.33 
 
 		 336 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0647  allantoicase  74.47 
 
 		 335 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0542  allantoicase  74.17 
 
 		 335 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830654  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2739  allantoicase  73.87 
 
 		 335 aa  511  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2651  allantoicase  64.48 
 
 		 334 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1342  allantoicase  59.59 
 
 		 349 aa  416  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0206885  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1323  allantoicase  61.49 
 
 		 343 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1704  allantoicase  56.07 
 
 		 331 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.935214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21110  allantoicase  56.56 
 
 		 333 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.871688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1807  allantoicase  53.89 
 
 		 331 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3668  allantoicase  53.58 
 
 		 331 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44850  allantoicase  55.62 
 
 		 332 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.195211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3820  allantoicase  55.8 
 
 		 332 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4868  allantoicase  40.24 
 
 		 355 aa  266  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5936  allantoicase  42.47 
 
 		 331 aa  242  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4857  Allantoicase  42.9 
 
 		 406 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.152506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0935  allantoicase  40.12 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  42.14 
 
 		 516 aa  236  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2589  allantoicase  41.46 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4725  allantoicase  40.12 
 
 		 346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0172758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4026  allantoicase  38.39 
 
 		 344 aa  230  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  41.76 
 
 		 520 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0236  allantoicase  40.81 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2779  Allantoicase  40.87 
 
 		 317 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5167  allantoicase  39.69 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4867  allantoicase  39.69 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4781  allantoicase  39.69 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489226  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0715  allantoicase  39.46 
 
 		 375 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0195  allantoicase  43.65 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2551  allantoicase  40.06 
 
 		 340 aa  215  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00391688  normal  0.383399 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55822  allantoinase  34.95 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00849553  hitchhiker  0.00710217 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_3787  predicted protein  36.12 
 
 		 333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03104  allantoicase, expressed, purine use (Eurofung)  35.71 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02340  allantoicase, putative  33.14 
 
 		 814 aa  176  5e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.649401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2840  Allantoicase  39.63 
 
 		 222 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>