14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0310 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0310  putative signal peptide protein  100 
 
 		 272 aa  530  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0165  Sporulation domain protein  64.73 
 
 		 261 aa  308  8e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.708881 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0172  Sporulation domain protein  65.46 
 
 		 259 aa  291  7e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0104  putative signal peptide protein  39.75 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0075  hypothetical protein  36.84 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3174  putative signal peptide protein  29.61 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.56163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3655  Sporulation domain protein  37.14 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116691  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3966  putative signal peptide protein  26.46 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2079  hypothetical protein  29.14 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3710  hypothetical protein  27.69 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4717  putative signal peptide protein  33.93 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2631  hypothetical protein  30.95 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08640  hypothetical protein  28.48 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000854998  hitchhiker  0.000197864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0818  hypothetical protein  29.77 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>