15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3787 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3787  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  314  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3365  hypothetical protein  98.72 
 
 
156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1614  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1662  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0657  hypothetical protein  34.45 
 
 
153 aa  67  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.970518  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4679  hypothetical protein  24 
 
 
222 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.768323  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1228  hypothetical protein  33.63 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3936  hypothetical protein  29.71 
 
 
166 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0280  hypothetical protein  33.72 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1884  hypothetical protein  33.67 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5468  hypothetical protein  28.77 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3716  hypothetical protein  32.33 
 
 
163 aa  51.2  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1686  gp11  27.27 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1363  hypothetical protein  29.73 
 
 
159 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1053  gp11  25.47 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.321055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>