261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3697 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3697  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic binding protein CysP  100 
 
 
330 aa  667    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3432  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  99.7 
 
 
330 aa  665    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400629 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1798  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  73.42 
 
 
332 aa  454  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.655228  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1854  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.68 
 
 
334 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.334824  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2331  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.49 
 
 
345 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1330  sulfate ABC transporter, sulfate-binding protein, putative  57.41 
 
 
334 aa  378  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.4153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1398  thiosulphate-binding protein  59.68 
 
 
336 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1290  putative sulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  57.1 
 
 
334 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1378  thiosulphate-binding protein  57.06 
 
 
335 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4018  thiosulphate-binding protein  56.76 
 
 
335 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.206129  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1005  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.46 
 
 
335 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.432024  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1099  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.45 
 
 
335 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0587643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3292  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.45 
 
 
335 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1066  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.55 
 
 
335 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0167374  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3333  thiosulphate-binding protein  59.49 
 
 
345 aa  359  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.885845  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0997  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.85 
 
 
335 aa  358  7e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.961901  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3012  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.13 
 
 
335 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.615219  normal  0.0264263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3092  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.13 
 
 
335 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0179342  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3189  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.13 
 
 
335 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.480893 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0065  thiosulfate ABC transporter, periplasmic thiosulfate-binding protein  54.41 
 
 
333 aa  355  3.9999999999999996e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3599  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.17 
 
 
335 aa  350  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3457  thiosulfate transporter subunit  50.46 
 
 
340 aa  349  4e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4410  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.44 
 
 
342 aa  345  4e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0652  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.47 
 
 
337 aa  344  8.999999999999999e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2105  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.25 
 
 
341 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2196  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.25 
 
 
345 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.559252  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2638  thiosulfate transporter subunit  52.44 
 
 
338 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2704  thiosulfate transporter subunit  52.12 
 
 
338 aa  342  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02325  thiosulfate transporter subunit  51.47 
 
 
338 aa  341  8e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02286  hypothetical protein  51.47 
 
 
338 aa  341  8e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2951  thiosulfate transporter subunit  49.69 
 
 
337 aa  341  9e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.339938 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2580  thiosulfate transporter subunit  51.47 
 
 
338 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1254  thiosulfate transporter subunit  51.47 
 
 
338 aa  341  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2561  thiosulfate transporter subunit  51.47 
 
 
338 aa  341  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3655  thiosulfate transporter subunit  51.47 
 
 
338 aa  341  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2680  thiosulfate transporter subunit  52.12 
 
 
338 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.886764  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1299  thiosulfate transporter subunit  48.46 
 
 
345 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1236  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.14 
 
 
338 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2769  thiosulfate transporter subunit  48.46 
 
 
345 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135265 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1408  thiosulfate transporter subunit  48.46 
 
 
345 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2711  thiosulfate transporter subunit  51.14 
 
 
338 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2589  thiosulfate transporter subunit  51.79 
 
 
338 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1373  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.83 
 
 
334 aa  339  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2810  thiosulfate transporter subunit  51.79 
 
 
338 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2797  thiosulfate transporter subunit  50.81 
 
 
338 aa  338  7e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0765  thiosulfate transporter subunit  50.49 
 
 
342 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1002  thiosulfate transporter subunit  49.68 
 
 
342 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.428472  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1211  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.71 
 
 
339 aa  335  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0110956  normal  0.0538246 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1274  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.4 
 
 
339 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  50 
 
 
331 aa  333  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1336  sulfate-binding precursor signal peptide protein  51.94 
 
 
336 aa  333  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.533362  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3400  thiosulphate-binding protein  51.68 
 
 
354 aa  332  4e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0940818  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0614  thiosulphate-binding protein  48.79 
 
 
329 aa  331  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.772188 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2077  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.23 
 
 
341 aa  330  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000402733  hitchhiker  0.00000000000000351214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45110  sulfate-binding protein of ABC transporter  50.16 
 
 
332 aa  325  9e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3894  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.07 
 
 
337 aa  324  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0402445  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2470  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic ligand binding protein, CysP  49.21 
 
 
346 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0297151  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3804  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.62 
 
 
337 aa  323  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3839  sulfate-binding protein of ABC transporter  49.84 
 
 
332 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1799  sulfate adenylyltransferase, large subunit  51.31 
 
 
807 aa  323  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6977  sulfate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  48.18 
 
 
329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1369  thiosulphate-binding protein  50.93 
 
 
335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327074  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0123  thiosulfate binding protein  49.39 
 
 
337 aa  320  3e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000442607 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4318  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.92 
 
 
338 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.980547  normal  0.223876 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4118  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.5 
 
 
359 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140992  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5479  sulfate adenylyltransferase, large subunit  50.32 
 
 
798 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0197363  decreased coverage  0.00943774 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5843  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.33 
 
 
341 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.302205  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4461  sulfate transporter subunit  48.47 
 
 
329 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1394  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.47 
 
 
338 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5372  sulfate transporter subunit  49.52 
 
 
329 aa  317  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1591  thiosulphate-binding protein  46.55 
 
 
332 aa  316  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00740648  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0169  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.92 
 
 
341 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03802  sulfate transporter subunit  49.52 
 
 
329 aa  316  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4068  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.52 
 
 
329 aa  316  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03751  hypothetical protein  49.52 
 
 
329 aa  316  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4357  sulfate transporter subunit  49.52 
 
 
329 aa  316  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4394  sulfate transporter subunit  48.16 
 
 
329 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.770755  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4101  sulfate transporter subunit  49.52 
 
 
329 aa  316  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4451  sulfate transporter subunit  49.52 
 
 
329 aa  316  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4148  sulfate transporter subunit  49.52 
 
 
329 aa  316  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4055  sulfate transporter subunit  50.16 
 
 
329 aa  315  6e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4280  sulfate transporter subunit  48.16 
 
 
329 aa  315  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0399629  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4392  sulfate transporter subunit  48.16 
 
 
329 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.694674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4397  sulfate transporter subunit  49.2 
 
 
329 aa  315  8e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1978  thiosulphate-binding protein  51.13 
 
 
335 aa  315  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6755  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48 
 
 
341 aa  315  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4267  sulfate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.71 
 
 
341 aa  315  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1906  thiosulphate-binding protein  49.18 
 
 
337 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896115  hitchhiker  0.00000000124986 
 
 
-
 
NC_004310  BR0107  sulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  48.02 
 
 
342 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2531  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.51 
 
 
356 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000783626  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0628  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.64 
 
 
335 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1552  thiosulphate-binding protein  45.06 
 
 
335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0443  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.4 
 
 
341 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4345  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.16 
 
 
332 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4309  sulfate transporter subunit  50 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1629  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.46 
 
 
347 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482062  normal  0.69185 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0122  thiosulfate binding protein  49.24 
 
 
337 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964738  decreased coverage  0.00000712106 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30540  Sulfate ABC transporter-binding component-CysP-like protein  47.58 
 
 
332 aa  311  6.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0089  sulfate transporter subunit  49.68 
 
 
329 aa  311  7.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1636  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.56 
 
 
345 aa  311  9e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.778191  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>