15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4139 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4139  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 105 aa  199  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1825  branched chain amino acid ABC transporter  89.52 
 
 		 105 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0791609  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1319  branched-chain amino acid transport  81.9 
 
 		 105 aa  167  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4738  branched-chain amino acid transport  87.62 
 
 		 105 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2156  branched-chain amino acid transport  44.68 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.716667 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3354  branched-chain amino acid transport  31.4 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0696  branched-chain amino acid transport  35.11 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1764  branched-chain amino acid transport  40 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240182  normal  0.0440928 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2037  putative transmembrane protein  37.14 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0733  branched-chain amino acid transport  34.69 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257385  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1118  branched-chain amino acid transport  41.18 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609203  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3177  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2876  branched-chain amino acid transport  35.09 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0584958  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000052  putative transmembrane protein  34.92 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.323073  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2666  branched-chain amino acid transport  38 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>