94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3347 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_3347  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
155 aa  324  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  96.77 
 
 
155 aa  314  4e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1463  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0158  GCN5-related N-acetyltransferase  26.28 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0125  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.328522 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2440  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
154 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.102944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2434  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3736  GCN5-related N-acetyltransferase  30.11 
 
 
252 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.944087  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2393  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
154 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0898256  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
174 aa  48.5  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.631657  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  26.13 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2923  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.972498  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0768  GCN5-related N-acetyltransferase  25.86 
 
 
155 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.633559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2342  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  26.39 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  25.33 
 
 
174 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.884644  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2026  GCN5-related N-acetyltransferase  28.72 
 
 
327 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0929  GCN5-related N-acetyltransferase  31.63 
 
 
186 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.568206 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0058  GCN5-related N-acetyltransferase  26.45 
 
 
330 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3522  GCN5-related N-acetyltransferase  26.36 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.395966  normal  0.175293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0933  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
204 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5542  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0856  GCN5-related N-acetyltransferase  28.41 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07340  predicted acyltransferase  27.17 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.633713  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3210  aminoglycoside N6'-acetyltransferase  29.91 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.938022  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0992  GCN5-related N-acetyltransferase  27.93 
 
 
191 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.552024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0955  GCN5-related N-acetyltransferase  27.93 
 
 
204 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22560  predicted acyltransferase  30.43 
 
 
105 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
181 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1392  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.62 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000164567  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0987  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  24.62 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229607  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  26.26 
 
 
143 aa  44.3  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0913  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 
169 aa  43.9  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000875  acetyltransferase GNAT family  23.91 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3796  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.583443  hitchhiker  0.000215605 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.87 
 
 
175 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106277  normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4724  GCN5-related N-acetyltransferase  29.08 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0556271 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3647  GCN5-related N-acetyltransferase  29.08 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0828  GCN5-related N-acetyltransferase  22.43 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3911  GCN5-related N-acetyltransferase  38.6 
 
 
891 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.680583  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1274  Phosphinothricin acetyltransferase  27.84 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768034  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0594  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  27.27 
 
 
297 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  30.69 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0309  GCN5-related N-acetyltransferase  28.07 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 
188 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
414 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4519  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
414 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2134  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.22 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2424  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.22 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3264  putative acetyltransferase  26.56 
 
 
150 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172457  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0488  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
167 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.89212  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1753  hypothetical protein  31 
 
 
154 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3131  putative phosphinothricin N-acetyltransferase  30.1 
 
 
190 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2328  GCN5-related N-acetyltransferase  23.53 
 
 
146 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000658467  normal  0.508858 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1411  GCN5-related N-acetyltransferase  27.55 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000201819  hitchhiker  0.000645315 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00969  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01380)  35.29 
 
 
238 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4023  GCN5-related N-acetyltransferase  30.25 
 
 
186 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210755  normal  0.806566 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3437  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 
206 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1462  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  26.76 
 
 
310 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.833654  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33160  acetyltransferase (GNAT) family protein  28.03 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0204184  normal  0.66835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0641  acetyltransferase  23.86 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000036985  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0694  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1241  GCN5-related N-acetyltransferase  25.19 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.595226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3851  GCN5-related N-acetyltransferase  26.51 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2975  acetyltransferase  27 
 
 
166 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0715346  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1901  GCN5-related N-acetyltransferase  32.79 
 
 
170 aa  41.2  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2917  GCN5-related N-acetyltransferase  26.21 
 
 
158 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0493  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
170 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.691777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4135  GCN5-related N-acetyltransferase  22.73 
 
 
399 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0441895  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5785  GCN5-related N-acetyltransferase  24.36 
 
 
400 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1154  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
186 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0181286  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1820  GCN5-related N-acetyltransferase  26.76 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.21 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2162  GCN5-related N-acetyltransferase  38.64 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862709  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13454  ribosomal protein alanine acetyltransferase rimI  26.76 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00191083  hitchhiker  0.000645998 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5631  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 
186 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.522089 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1122  GCN5-related N-acetyltransferase  26.75 
 
 
184 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0293431  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  26.28 
 
 
893 aa  40.8  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1329  GCN5-related N-acetyltransferase  24.11 
 
 
414 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6192  GCN5-related N-acetyltransferase  27.36 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0101  GCN5-related N-acetyltransferase  29.57 
 
 
193 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5238  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 
900 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2457  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 
167 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4771  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 
900 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2356  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
282 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  24.64 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1715  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.77 
 
 
168 aa  40.4  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11190  sortase-like acyltransferase  27.52 
 
 
171 aa  40.4  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0130683  normal  0.626288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8254  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  24.42 
 
 
314 aa  40.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
158 aa  40.4  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5313  GCN5-related N-acetyltransferase  28.42 
 
 
900 aa  40.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.653204  normal  0.891732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>