39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0125 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0125  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
158 aa  322  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.328522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2923  GCN5-related N-acetyltransferase  89.33 
 
 
150 aa  272  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.972498  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3210  aminoglycoside N6'-acetyltransferase  83.33 
 
 
150 aa  259  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.938022  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1736  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  52.21 
 
 
145 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.771756  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1733  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  52.21 
 
 
145 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.247434  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1797  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  51.82 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1723  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  52.21 
 
 
145 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.173475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1542  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  52.21 
 
 
145 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1807  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  54.07 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0452712  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0805  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  54.07 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2069  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  54.07 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1096  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  54.07 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3976  GCN5-related N-acetyltransferase  40.82 
 
 
147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0158  GCN5-related N-acetyltransferase  42.14 
 
 
143 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  41.26 
 
 
143 aa  100  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2328  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 
146 aa  97.1  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000658467  normal  0.508858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0154  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2756  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.159719  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0666  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0252613  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0462  aminoglycoside acetyltransferase (6) type I  74.42 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1485  GCN5-related N-acetyltransferase  36.5 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0463  hypothetical protein  41.18 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3347  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
155 aa  51.2  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1473  putative acetyltransferase  26.43 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  28.16 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1216  GCN5-related N-acetyltransferase  28.71 
 
 
301 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  27.18 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0134  GCN5-related N-acetyltransferase  40.58 
 
 
785 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3280  GCN5-related N-acetyltransferase  40.58 
 
 
846 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0316376 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0188  putative acetyltransferase  36.49 
 
 
169 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340862  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5525  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
806 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5336  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
785 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1857  GCN5-related N-acetyltransferase  25.69 
 
 
345 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.873376 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1816  putative transmembrane protein  27 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  36.96 
 
 
297 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  37.68 
 
 
813 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2931  GCN5-related N-acetyltransferase  33.93 
 
 
141 aa  40.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  23.48 
 
 
154 aa  40.4  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>