46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0323 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
282 aa  564  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0385  GCN5-related N-acetyltransferase  84.29 
 
 
299 aa  410  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3037  GCN5-related N-acetyltransferase  37.12 
 
 
311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal  0.648395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6394  GCN5-related N-acetyltransferase  35.61 
 
 
302 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0057  GCN5-related N-acetyltransferase  27.99 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0058  GCN5-related N-acetyltransferase  27.1 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1513  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 
322 aa  68.9  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  25.46 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.163048  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0370  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1054  GCN5-related N-acetyltransferase  31.09 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2083  GCN5-related N-acetyltransferase  30.13 
 
 
369 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45347  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1057  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
634 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258584  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0790  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6109  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
339 aa  48.9  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2723  GCN5-related N-acetyltransferase  37.72 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.531068  normal  0.0776544 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1332  GCN5-related N-acetyltransferase  32.99 
 
 
167 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.855174  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0214  hypothetical protein  32.91 
 
 
171 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3082  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
241 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314403  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0208  hypothetical protein  32.91 
 
 
171 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6107  GCN5-related N-acetyltransferase  24.91 
 
 
341 aa  45.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3377  GCN5-related N-acetyltransferase  41.56 
 
 
143 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30670  sortase-like acyltransferase  52.94 
 
 
161 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479101  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5102  GCN5-related N-acetyltransferase  26.45 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0705936  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2344  GCN5-related N-acetyltransferase  51.06 
 
 
344 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.231095  normal  0.451017 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4248  GCN5-related N-acetyltransferase  27.56 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357706  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1055  hypothetical protein  30.16 
 
 
153 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5134  GCN5-related N-acetyltransferase  38.27 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1515  GCN5-related N-acetyltransferase  27.84 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2473  GCN5-related N-acetyltransferase  51.06 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584305  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1638  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
178 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0910  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 
165 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329929  normal  0.100371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6111  GCN5-related N-acetyltransferase  35.16 
 
 
337 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.634814  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  31.46 
 
 
155 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0847  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
165 aa  42.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6108  GCN5-related N-acetyltransferase  33.87 
 
 
337 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0477  GCN5-related N-acetyltransferase  52.08 
 
 
250 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  40.7 
 
 
176 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2992  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
363 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.723176  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1491  hypothetical protein  30.39 
 
 
290 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405441  hitchhiker  0.00239117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0857  aminoglycoside N(6')-acetyltransferase  40.38 
 
 
193 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.894677  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  40.7 
 
 
176 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2565  putative acetyltransferase protein  39.24 
 
 
177 aa  42.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
174 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139138 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
174 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3014  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
174 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
174 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>