33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2344 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2344  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
344 aa  700    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.231095  normal  0.451017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2473  GCN5-related N-acetyltransferase  86.34 
 
 
343 aa  587  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584305  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0057  GCN5-related N-acetyltransferase  32.51 
 
 
321 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0058  GCN5-related N-acetyltransferase  32.49 
 
 
330 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1513  GCN5-related N-acetyltransferase  32.72 
 
 
322 aa  123  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1515  GCN5-related N-acetyltransferase  32.16 
 
 
326 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  32.1 
 
 
339 aa  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.163048  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1057  GCN5-related N-acetyltransferase  33.46 
 
 
634 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258584  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1054  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
331 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0369  GCN5-related N-acetyltransferase  30.03 
 
 
331 aa  93.2  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0059  GCN5-related N-acetyltransferase  34.9 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.821201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6394  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
302 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4647  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  27.01 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0723  GCN5-related N-acetyltransferase  27.31 
 
 
340 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00134722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3210  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.293411  hitchhiker  0.00000000477166 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02570  hypothetical protein  34.69 
 
 
330 aa  60.1  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.498225  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0370  GCN5-related N-acetyltransferase  31.2 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2725  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  25.42 
 
 
323 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00719898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6108  GCN5-related N-acetyltransferase  27.24 
 
 
337 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3785  GCN5-related protein N-acetyltransferase  25.51 
 
 
368 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0643958  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  28.92 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00168273  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3911  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
891 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.680583  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3013  GCN5-related N-acetyltransferase  26.69 
 
 
323 aa  47  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.624033  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04993  acetyltransferase, GNAT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09940)  28.03 
 
 
213 aa  46.6  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0636839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6822  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  25 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
185 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533995  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  24.7 
 
 
282 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.43 
 
 
156 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3037  GCN5-related N-acetyltransferase  40.35 
 
 
311 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal  0.648395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2338  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 
177 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174627  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0451  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  29.36 
 
 
295 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.237261  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0813  putative acetyltransferase  42.59 
 
 
161 aa  43.5  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.425962  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5134  GCN5-related N-acetyltransferase  25.97 
 
 
337 aa  43.1  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>