21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2538 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2538  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2931  hypothetical protein  76.92 
 
 		 78 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4053  hypothetical protein  61.11 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2814  pentapeptide MXKDX repeat protein  60.26 
 
 		 79 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2530  hypothetical protein  51.55 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3133  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  74 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal  0.206734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1511  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  70.83 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.144611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2570  pentapeptide MXKDX repeat protein  44.83 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0310  pentapeptide MXKDX repeat protein  50.67 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0298  pentapeptide MXKDX repeat protein  50.67 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2593  hypothetical protein  54.05 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0020  hypothetical protein  48.75 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2991  pentapeptide MXKDX repeat protein  66 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272043  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0540  hypothetical protein  67.39 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2731  hypothetical protein  61.54 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172905 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1517  hypothetical protein  62.5 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2179  hypothetical protein  67.5 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.565445 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2843  hypothetical protein  49.32 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0017  hypothetical protein  46.34 
 
 		 78 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4814  pentapeptide MXKDX repeat protein  43.42 
 
 		 82 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.901496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1196  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  56.52 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0762518  normal  0.338058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>