15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2164 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2164  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.107733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2319  hypothetical protein  99.66 
 
 		 291 aa  591  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6577  hypothetical protein  38.12 
 
 		 585 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2763  hypothetical protein  29.38 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3313  hypothetical protein  26.49 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2614  hypothetical protein  31.16 
 
 		 233 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  26.8 
 
 		 301 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1614  hypothetical protein  28.37 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  27.87 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0620  nucleotide-binding protein containing TIR -like protein domain-like protein  29.85 
 
 		 507 aa  43.5  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  28.78 
 
 		 596 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  23.97 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  25.16 
 
 		 151 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  23.56 
 
 		 273 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  23.56 
 
 		 273 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>