27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1934 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1934  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  270  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.896486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3531  hypothetical protein  93.33 
 
 		 135 aa  255  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2045  hypothetical protein  86.67 
 
 		 135 aa  246  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1766  hypothetical protein  82.96 
 
 		 135 aa  231  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2232  hypothetical protein  74.07 
 
 		 135 aa  207  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2632  hypothetical protein  70.37 
 
 		 152 aa  204  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3027  hypothetical protein  69.63 
 
 		 135 aa  199  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3311  molybdenum cofactor biosynthesis protein  48.89 
 
 		 135 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1691  hypothetical protein  43.51 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0772  ferredoxin  40.46 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  39.69 
 
 		 349 aa  94  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2674  putative cytoplasmic protein  34.81 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  40.62 
 
 		 360 aa  93.6  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  36.3 
 
 		 356 aa  89  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0279  conserved hypothetical cytosolic protein  37.04 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  36.64 
 
 		 355 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0665  hypothetical protein  32.33 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0649  hypothetical protein  31.58 
 
 		 134 aa  85.5  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  36.92 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4395  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.85 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779204  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2883  hypothetical protein  34.35 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2730  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.84 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2617  hypothetical protein  34.92 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4368  hypothetical protein  34.41 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0368  hypothetical protein  26.15 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0509  hypothetical protein  31.19 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2758  hypothetical protein  25.19 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000647849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>