19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1924 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1924  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139586  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3541  hypothetical protein  75.1 
 
 		 262 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2036  hypothetical protein  72.31 
 
 		 261 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3020  hypothetical protein  62.5 
 
 		 258 aa  318  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1755  hypothetical protein  59.85 
 
 		 257 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.147362 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2239  hypothetical protein  59.77 
 
 		 270 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2639  hypothetical protein  61.34 
 
 		 276 aa  289  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1706  hypothetical protein  31.72 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0984595  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5143  hypothetical protein  25.64 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  22.88 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0631  hypothetical protein  27.69 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1111  hypothetical protein  30.51 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254819  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  25.17 
 
 		 370 aa  46.6  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2924  hypothetical protein  29.2 
 
 		 272 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.512555  hitchhiker  0.0000388808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  27.46 
 
 		 361 aa  45.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1420  hypothetical protein  26.81 
 
 		 309 aa  45.4  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2870  protein of unknown function DUF1311  26.03 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2663  hypothetical protein  26.19 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0705071 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0714  hypothetical protein  30.77 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.703561 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>