More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1409 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1409  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 220 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.207515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1430  integral membrane protein TerC  88.43 
 
 		 216 aa  337  8e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3975  integral membrane protein TerC  84.02 
 
 		 220 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.790296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4666  Integral membrane protein TerC  81.22 
 
 		 211 aa  308  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50961  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0688  integral membrane protein TerC  69.63 
 
 		 217 aa  267  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8206  Integral membrane protein TerC  70.05 
 
 		 227 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1799  Integral membrane protein TerC  71.98 
 
 		 201 aa  256  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.099096  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1799  integral membrane protein TerC  68.98 
 
 		 212 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.916732  decreased coverage  0.000172581 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1987  Integral membrane protein TerC  70.53 
 
 		 208 aa  252  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417869  hitchhiker  0.00928883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1152  integral membrane protein TerC  64.56 
 
 		 213 aa  230  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2846  integral membrane protein TerC  55.39 
 
 		 240 aa  204  7e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0648136 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1604  integral membrane protein TerC  61.54 
 
 		 246 aa  201  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3018  integral membrane protein TerC  58.03 
 
 		 212 aa  188  7e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2839  integral membrane protein TerC  56.87 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3428  Integral membrane protein TerC  51.49 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0388  Integral membrane protein TerC  43.65 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.10914  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3292  Integral membrane protein TerC  41.12 
 
 		 229 aa  132  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000553264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1266  Integral membrane protein TerC  41.95 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3371  Integral membrane protein TerC  36.55 
 
 		 233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000908977  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0820  Integral membrane protein TerC  39 
 
 		 230 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0891  Integral membrane protein TerC  38.5 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.927999 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1310  hypothetical protein  37.8 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.869179  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1209  Integral membrane protein TerC  40.22 
 
 		 249 aa  109  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1243  hypothetical protein  39.27 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1110  hypothetical protein  38.28 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1098  integral membrane protein TerC  39.27 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1348  hypothetical protein  37.8 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0643228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1201  hypothetical protein  38.28 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0242206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1271  hypothetical protein  38.28 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1092  membrane protein  38.28 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1086  membrane protein  39.27 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2326  integral membrane protein TerC  39.11 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4045  integral membrane protein TerC  37.63 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3390  Integral membrane protein TerC  37.63 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0905  integral membrane protein TerC  38.65 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4099  hypothetical protein  36.84 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6290  Integral membrane protein TerC  38.89 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.06689  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3022  integral membrane protein TerC  36.76 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0815  TerC family integral membrane protein  41.4 
 
 		 237 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0978  TerC family integral membrane protein  41.4 
 
 		 270 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0819  TerC family integral membrane protein  41.4 
 
 		 270 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4682  integral membrane protein TerC  39.25 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2399  TerC family integral membrane protein  40.86 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0277  TerC family integral membrane protein  40.86 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2677  TerC family integral membrane protein  40.86 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.849406  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0012  TerC family integral membrane protein  40.86 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0949  hypothetical protein  39.5 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0295104 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2986  hypothetical protein  42.58 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000888326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2290  hypothetical protein  40.67 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000535786  hitchhiker  1.74959e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2736  hypothetical protein  41.15 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00167476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2665  integral membrane protein  41.15 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2945  hypothetical protein  41.15 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.89951e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2946  hypothetical protein  41.15 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000002611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2992  hypothetical protein  41.15 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000237739  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2567  integral membrane protein TerC  40.3 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2687  integral membrane protein  40.67 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.99686e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1619  Integral membrane protein TerC  34.69 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0916  integral membrane protein TerC  41 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.968219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0926  putative transmembrane protein  36.18 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00232112  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1401  Integral membrane protein TerC  39.59 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0194  integral membrane protein TerC  36.59 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2473  integral membrane protein TerC  35.36 
 
 		 243 aa  95.9  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0648  TerC family integral membrane protein  40.32 
 
 		 237 aa  95.5  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0070  hypothetical protein  36.1 
 
 		 234 aa  95.1  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.693932  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2950  hypothetical protein  40.19 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000304584  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0764  Integral membrane protein TerC  36.21 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0445  integral membrane protein TerC  37.11 
 
 		 237 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.620391 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3512  integral membrane protein TerC  38.14 
 
 		 251 aa  92  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0508752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0428  integral membrane protein TerC  37.19 
 
 		 225 aa  88.6  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236492  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3362  integral membrane protein TerC  36.36 
 
 		 233 aa  88.6  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0867  integral membrane protein TerC  34.95 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3951  integral membrane protein TerC  34.62 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480576 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4044  integral membrane protein TerC  36.04 
 
 		 239 aa  85.9  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0805  integral membrane protein TerC  31.55 
 
 		 258 aa  85.9  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0662924  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4680  integral membrane protein TerC  34.57 
 
 		 233 aa  85.5  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2694  integral membrane protein TerC  35.19 
 
 		 251 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5173  Integral membrane protein TerC  34.95 
 
 		 249 aa  84.7  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5190  Integral membrane protein TerC  37.5 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3943  integral membrane protein TerC  35.75 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0655  integral membrane protein TerC  37.5 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.315184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2327  hypothetical protein  33.5 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3917  integral membrane protein TerC  36.55 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0557397  hitchhiker  0.00349463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3290  Integral membrane protein TerC  39.53 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0586627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0676  hypothetical protein  35.71 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3465  hypothetical protein  34.04 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2676  integral membrane protein TerC  35.65 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0569  Integral membrane protein TerC  34.81 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3864  integral membrane protein TerC  36.04 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4666  integral membrane protein TerC  36.04 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2036  integral membrane protein TerC  35.65 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2647  integral membrane protein TerC  35.65 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2568  integral membrane protein TerC  35.19 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.831919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2845  Integral membrane protein TerC  34.34 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100755 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1829  integral membrane protein TerC  38.57 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106378  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49290  hypothetical protein  35 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608351  normal  0.0100371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3386  hypothetical protein  32.46 
 
 		 346 aa  75.9  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4210  hypothetical protein  34.88 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  28.51 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1545  Integral membrane protein TerC  39.01 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.654667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0857  integral membrane protein TerC  34.55 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>