More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0889 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_0889  phosphate ABC transporter permease  100 
 
 
333 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0777  phosphate ABC transporter permease  89.49 
 
 
332 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5265  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  92.67 
 
 
333 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4922  phosphate ABC transporter permease  86.79 
 
 
333 aa  524  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.619069  normal  0.520266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0636  phosphate ABC transporter permease  83.18 
 
 
332 aa  527  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.284804  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1987  high-affinity phosphate ABC transporter membrane protein  84.04 
 
 
332 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0507  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  78.98 
 
 
341 aa  494  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.54837 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0838  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  62.46 
 
 
329 aa  408  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  60.87 
 
 
328 aa  363  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.222291 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1137  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  56.49 
 
 
325 aa  347  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1486  phosphate transporter permease subunit PstC  56.49 
 
 
312 aa  341  9e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1516  phosphate transporter permease subunit PstC  56.49 
 
 
312 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.847458  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0781  phosphate transporter permease subunit PstC  56.49 
 
 
328 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1619  phosphate transporter permease subunit PstC  56.49 
 
 
328 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0575  phosphate transporter permease subunit PstC  56.49 
 
 
328 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1292  phosphate transporter permease subunit PstC  56.49 
 
 
328 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0576  phosphate transporter permease subunit PstC  56.49 
 
 
312 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2832  phosphate ABC transporter permease protein  57.42 
 
 
324 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4444  phosphate transporter permease subunit PstC  55.52 
 
 
328 aa  339  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2772  phosphate transporter permease subunit PstC  53.43 
 
 
328 aa  339  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1927  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstC  56.96 
 
 
316 aa  338  5.9999999999999996e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0123296  normal  0.0315714 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2019  phosphate transporter permease subunit PstC  53.13 
 
 
328 aa  338  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2220  phosphate ABC transporter permease  57.14 
 
 
316 aa  338  9e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.253336  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4232  phosphate transporter permease subunit PstC  54.52 
 
 
318 aa  337  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.691548  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4170  phosphate transporter permease subunit PstC  54.52 
 
 
318 aa  337  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4196  phosphate transporter permease subunit PstC  54.52 
 
 
318 aa  337  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  normal  0.0245807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1530  phosphate transporter permease subunit PstC  54.1 
 
 
321 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1272  phosphate transporter permease subunit PstC  55.21 
 
 
328 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0820  phosphate transporter permease subunit PstC  55.21 
 
 
328 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1301  phosphate transporter permease subunit PstC  55.21 
 
 
328 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446821  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03611  phosphate transporter subunit  53.42 
 
 
319 aa  332  4e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4240  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.42 
 
 
319 aa  332  4e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4238  phosphate transporter permease subunit PstC  53.42 
 
 
319 aa  332  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4267  phosphate transporter permease subunit PstC  53.42 
 
 
319 aa  332  4e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.879292  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4187  phosphate transporter permease subunit PstC  53.42 
 
 
319 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4081  phosphate transporter permease subunit PstC  53.42 
 
 
319 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4244  phosphate transporter permease subunit PstC  53.42 
 
 
319 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4065  phosphate transporter permease subunit PstC  53.42 
 
 
319 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4137  phosphate transporter permease subunit PstC  53.42 
 
 
319 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5156  phosphate transporter permease subunit PstC  53.42 
 
 
319 aa  332  4e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.558018 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03555  hypothetical protein  53.42 
 
 
319 aa  332  4e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3942  phosphate transporter permease subunit PstC  53.42 
 
 
319 aa  332  4e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4201  phosphate transporter permease subunit PstC  53.42 
 
 
319 aa  332  4e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4091  phosphate transporter permease subunit PstC  53.42 
 
 
319 aa  331  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.541621 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1601  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.37 
 
 
328 aa  329  5.0000000000000004e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2269  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  57.28 
 
 
316 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0883  phosphate transporter permease subunit PstC  51.2 
 
 
332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1273  phosphate transport system permease protein  53.11 
 
 
340 aa  325  5e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1267  phosphate transporter permease subunit PstC  52.4 
 
 
333 aa  322  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27434  normal  0.233798 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2025  phosphate transporter permease subunit PstC  56.47 
 
 
324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619161  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1717  phosphate transporter permease subunit PstC  57.47 
 
 
312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2857  phosphate transporter permease subunit PstC  51.2 
 
 
333 aa  318  7e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2813  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.92 
 
 
322 aa  318  7.999999999999999e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0013  phosphate transporter permease subunit PstC  55.12 
 
 
318 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468415  normal  0.0760881 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2166  phosphate transporter permease subunit PstC  57.39 
 
 
321 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450116  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2312  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.63 
 
 
359 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1487  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.62 
 
 
337 aa  316  4e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2371  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.62 
 
 
337 aa  316  4e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.563531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0582  phosphate ABC transporter permease  52.63 
 
 
343 aa  315  5e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0697516  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4585  phosphate transporter permease subunit PstC  53.9 
 
 
319 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4138  phosphate transporter permease subunit PstC  54.07 
 
 
319 aa  314  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1796  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.68 
 
 
325 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00856556  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1292  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.79 
 
 
338 aa  314  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2184  phosphate transporter permease subunit PstC  56.01 
 
 
321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.184456  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4264  phosphate transporter permease subunit PstC  53.9 
 
 
319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1178  phosphate transporter permease subunit PstC  55.21 
 
 
328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1190  phosphate transporter permease subunit PstC  54.89 
 
 
328 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227903  normal  0.373364 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2627  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.3 
 
 
337 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.107614 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4000  phosphate transporter permease subunit PstC  54.55 
 
 
319 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4917  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  56.32 
 
 
312 aa  306  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.066084  normal  0.437846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1333  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50.82 
 
 
325 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282843  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1310  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.7 
 
 
322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.648336  normal  0.22532 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00542  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  51.38 
 
 
324 aa  302  6.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4209  phosphate transporter permease subunit PstC  55.63 
 
 
326 aa  301  8.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2253  phosphate ABC transporter permease  52.53 
 
 
343 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.279432  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5253  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50.31 
 
 
324 aa  299  5e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1103  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50.64 
 
 
317 aa  298  8e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0869195  normal  0.668391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0198  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.24 
 
 
325 aa  295  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3268  phosphate ABC transporter, permease protein  54.58 
 
 
331 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3105  phosphate ABC transporter permease  54.58 
 
 
331 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44222  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4714  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.86 
 
 
324 aa  292  6e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.332449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5181  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.86 
 
 
324 aa  292  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.886508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2343  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.25 
 
 
325 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385767  normal  0.815793 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2205  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.47 
 
 
321 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.650136  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1347  ABC transporter phosphate permease  51.82 
 
 
324 aa  290  3e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.225213  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1283  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.82 
 
 
324 aa  290  3e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6689  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50.71 
 
 
324 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7427  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50.54 
 
 
324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178252  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1154  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.43 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1437  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  51.43 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177965  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3270  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.82 
 
 
331 aa  247  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263457  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2684  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.49 
 
 
305 aa  246  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.070579  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0742  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.48 
 
 
316 aa  238  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000564451  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2829  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.38 
 
 
322 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594709  normal  0.637207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3294  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.38 
 
 
322 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0819  phosphate ABC transporter permease  46.33 
 
 
315 aa  236  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2216  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  41.67 
 
 
324 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  0.140551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2478  phosphate ABC transporter permease  41.1 
 
 
316 aa  226  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1091  phosphate ABC transporter permease  43.63 
 
 
329 aa  224  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1397  phosphate ABC transporter permease  44.12 
 
 
315 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal  0.553355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>