17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4599 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4599  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  253  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1247  hypothetical protein  63.28 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3869  hypothetical protein  60.77 
 
 		 130 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.748627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1438  protein of unknown function DUF1469  57.69 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157465  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3878  hypothetical protein  41.46 
 
 		 131 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.716332  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  37.8 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  33.06 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  31.67 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  31.78 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  31.11 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  28.68 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3900  putative nutrient deprivation-induced protein  31.88 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0615251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  43.4 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1655  hypothetical protein  28.57 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3142  hypothetical protein  36 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  28.71 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  29.5 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.182455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>