60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3868 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3887    100 
 
 		 261 bp  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3868    100 
 
 		 261 bp  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  81.63 
 
 		 267 bp  129  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  84.93 
 
 		 267 bp  115  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  84.93 
 
 		 267 bp  115  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  84.93 
 
 		 267 bp  115  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5713    84.93 
 
 		 1992 bp  115  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  84.93 
 
 		 267 bp  115  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2926  transposase IS3/IS911  84.76 
 
 		 201 bp  81.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2044  transposase IS3/IS911  87.84 
 
 		 321 bp  75.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  82.98 
 
 		 267 bp  73.8  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2510  transposase  95.35 
 
 		 267 bp  69.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.021123 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0927  transposase IS3/IS911 family protein  95.35 
 
 		 228 bp  69.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0403  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  95.35 
 
 		 267 bp  69.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.868889 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3735  transposase IS3/IS911 family protein  85.54 
 
 		 324 bp  69.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  85.06 
 
 		 267 bp  69.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2385  transposase IS3/IS911 family protein  85.06 
 
 		 213 bp  69.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  85.06 
 
 		 267 bp  69.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  85.06 
 
 		 267 bp  69.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  85.06 
 
 		 267 bp  69.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3356  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  95.35 
 
 		 267 bp  69.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4090  transposase IS3/IS911 family protein  95.35 
 
 		 267 bp  69.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.702583  normal  0.16367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2592    86.49 
 
 		 257 bp  67.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.743625  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1493  ISRSO14-transposase ORFA protein  83.33 
 
 		 264 bp  67.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504029  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2406  ISRSO14-transposase ORFA protein  83.33 
 
 		 264 bp  67.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1216  ISRSO14-transposase ORFA protein  83.33 
 
 		 264 bp  67.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0829  ISRSO14-transposase ORFA protein  83.33 
 
 		 264 bp  67.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6020  transposase IS3/IS911 family protein  91.67 
 
 		 267 bp  63.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6210    80.54 
 
 		 263 bp  58  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  89.58 
 
 		 267 bp  56  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  89.58 
 
 		 267 bp  56  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  89.58 
 
 		 267 bp  56  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1093  transposase IS3/IS911 family protein  96.88 
 
 		 255 bp  56  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1610  transposase IS3/IS911 family protein  96.88 
 
 		 294 bp  56  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2759  transposase IS3/IS911 family protein  90.91 
 
 		 267 bp  56  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  89.58 
 
 		 267 bp  56  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2497    89.58 
 
 		 1092 bp  56  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0863968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  89.58 
 
 		 1182 bp  56  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1495  transposase IS3/IS911 family protein  90.7 
 
 		 267 bp  54  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5642    82.76 
 
 		 1121 bp  54  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.330128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5637    82.76 
 
 		 1121 bp  54  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  79.45 
 
 		 267 bp  52  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5393  hypothetical protein  84.85 
 
 		 285 bp  52  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.314254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  79.45 
 
 		 267 bp  52  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2460  transposase IS3/IS911 family protein  92.11 
 
 		 897 bp  52  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  79.45 
 
 		 267 bp  52  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2601  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 267 bp  52  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_004310  BR0515    88.89 
 
 		 225 bp  50.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.291374  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2475  integrase, catalytic region  90.24 
 
 		 183 bp  50.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2485  integrase, catalytic region  90.24 
 
 		 183 bp  50.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.252644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0519    88.89 
 
 		 268 bp  50.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  88.64 
 
 		 267 bp  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 1710 bp  48.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2763  transposase IS3/IS911 family protein  88.64 
 
 		 240 bp  48.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.577864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4647  transposase IS3/IS911 family protein  81.61 
 
 		 264 bp  46.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0787  hypothetical protein  91.43 
 
 		 621 bp  46.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0806  hypothetical protein  91.43 
 
 		 804 bp  46.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1235  transposase IS3/IS911 family protein  91.43 
 
 		 267 bp  46.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1288  transposase IS3/IS911 family protein  91.43 
 
 		 267 bp  46.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2193  transposase IS3/IS911 family protein  91.43 
 
 		 267 bp  46.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>