27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1766 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1766  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  273  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1934  hypothetical protein  82.96 
 
 		 135 aa  231  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.896486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2045  hypothetical protein  82.96 
 
 		 135 aa  231  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3531  hypothetical protein  83.7 
 
 		 135 aa  230  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2232  hypothetical protein  72.59 
 
 		 135 aa  205  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2632  hypothetical protein  71.11 
 
 		 152 aa  200  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3027  hypothetical protein  68.89 
 
 		 135 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3311  molybdenum cofactor biosynthesis protein  47.41 
 
 		 135 aa  130  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1691  hypothetical protein  41.22 
 
 		 134 aa  103  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0772  ferredoxin  40.15 
 
 		 134 aa  98.2  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2674  putative cytoplasmic protein  34.07 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  40.15 
 
 		 349 aa  91.7  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  39.06 
 
 		 360 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0279  conserved hypothetical cytosolic protein  34.81 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4395  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.85 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2730  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.84 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0665  hypothetical protein  31.58 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  35.16 
 
 		 355 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0649  hypothetical protein  30.83 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  36.67 
 
 		 356 aa  77.8  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  39.17 
 
 		 355 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2617  hypothetical protein  31.3 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2883  hypothetical protein  30.53 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0368  hypothetical protein  26.92 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4368  hypothetical protein  29.07 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2758  hypothetical protein  27.48 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000647849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0509  hypothetical protein  26.56 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>