30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4526 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4526  hypothetical protein  100 
 
 		 540 aa  1058    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4364  hypothetical protein  82.16 
 
 		 547 aa  711    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0965  protein of unknown function DUF459  65.28 
 
 		 561 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522064  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0771  hypothetical protein  67.55 
 
 		 565 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6961  hypothetical protein  59.57 
 
 		 600 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1133  hypothetical protein  60.94 
 
 		 539 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2956  hypothetical protein  61.16 
 
 		 538 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.48532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0038  hypothetical protein  32.92 
 
 		 474 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.034989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1173  protein of unknown function DUF459  31.85 
 
 		 485 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235474  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3055  hypothetical protein  31.09 
 
 		 432 aa  162  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1808  hypothetical protein  31.88 
 
 		 481 aa  154  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3880  protein of unknown function DUF459  29.15 
 
 		 409 aa  154  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3469  protein of unknown function DUF459  27.58 
 
 		 480 aa  147  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1975  hypothetical protein  32.48 
 
 		 428 aa  143  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3271  hypothetical protein  28.46 
 
 		 485 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.523182 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2709  hypothetical protein  39.91 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3595  protein of unknown function DUF459  28.46 
 
 		 485 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3613  protein of unknown function DUF459  31.15 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0057  hypothetical protein  31.52 
 
 		 383 aa  136  8e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3728  hypothetical protein  29.53 
 
 		 408 aa  136  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3315  protein of unknown function DUF459  28.53 
 
 		 403 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2741  hypothetical protein  28.91 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4274  hypothetical protein  39.32 
 
 		 372 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0052  hypothetical protein  36.89 
 
 		 383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1957  hypothetical protein  27.63 
 
 		 331 aa  92  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3458  GDSL family lipase  30.1 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280309  normal  0.0118251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0459  hypothetical protein  26.32 
 
 		 299 aa  55.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0947626  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0713  hypothetical protein  27.68 
 
 		 336 aa  50.4  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0639  hypothetical protein  27.68 
 
 		 336 aa  50.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.962906  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1060  hypothetical protein  26.79 
 
 		 332 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.93231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>