36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4128 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4128  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 355 aa  731    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0249941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3119  hypothetical protein  27.36 
 
 		 485 aa  99.8  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2636  putative adenylate/guanylate cyclase  33.12 
 
 		 611 aa  93.2  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.416157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1263  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 588 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0546633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  30.41 
 
 		 735 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  25 
 
 		 518 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1205  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  33.64 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  27.64 
 
 		 473 aa  47.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  24.49 
 
 		 317 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20801  adenine glycosylase  32.71 
 
 		 384 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 167 aa  46.2  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  22.39 
 
 		 479 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  25.37 
 
 		 139 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  30.38 
 
 		 132 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  28.26 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1901  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  28.12 
 
 		 581 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  25.93 
 
 		 465 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  24.44 
 
 		 320 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  24.44 
 
 		 320 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 		 144 aa  43.5  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  24.79 
 
 		 383 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0647  MutT/nudix family protein  23.36 
 
 		 152 aa  43.5  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  24.14 
 
 		 701 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  30.38 
 
 		 132 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.45 
 
 		 629 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  28.97 
 
 		 130 aa  43.1  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  21.25 
 
 		 523 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2431  NUDIX hydrolase  26.73 
 
 		 132 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00584965  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 		 147 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  25.71 
 
 		 311 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  25.71 
 
 		 311 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  31.58 
 
 		 386 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 132 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  25.71 
 
 		 311 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  24.69 
 
 		 463 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>