28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1450 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1450  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1427  hypothetical protein  96.67 
 
 		 60 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.211415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4651  hypothetical protein  78.33 
 
 		 60 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3957  hypothetical protein  81.67 
 
 		 60 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1004  hypothetical protein  73.77 
 
 		 61 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.156791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1239  hypothetical protein  72.13 
 
 		 61 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.111273  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2079  protein of unknown function DUF465  66.67 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2690  hypothetical protein  66.67 
 
 		 61 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663367  normal  0.75863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1066  hypothetical protein  56.67 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2670  hypothetical protein  62.07 
 
 		 57 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169665  normal  0.21377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3409  hypothetical protein  54.39 
 
 		 59 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1914  protein of unknown function DUF465  60 
 
 		 58 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2598  hypothetical protein  50 
 
 		 59 aa  64.3  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1171  hypothetical protein  50.94 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1959  hypothetical protein  58.33 
 
 		 58 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2235  protein of unknown function DUF465  58.33 
 
 		 58 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.878546 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1941  protein of unknown function DUF465  50 
 
 		 62 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0443  hypothetical protein  52.83 
 
 		 61 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.427552  normal  0.0699724 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1682  hypothetical protein  47.17 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1741  hypothetical protein  47.17 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.339434  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2082  hypothetical protein  51.92 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334983  hitchhiker  0.000000000000216379 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3272  protein of unknown function DUF465  54.72 
 
 		 57 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3571  protein of unknown function DUF465  50.94 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0658727 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2028  hypothetical protein  46.15 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3680  hypothetical protein  54.55 
 
 		 57 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3069  protein of unknown function DUF465  45.28 
 
 		 55 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2571  hypothetical protein  37.74 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3739  hypothetical protein  40 
 
 		 55 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>