13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2935 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2935  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  261  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3078  hypothetical protein  93.75 
 
 
128 aa  251  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3782  hypothetical protein  43.22 
 
 
158 aa  103  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00124046  normal  0.0210619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2244  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0564  hypothetical protein  29.66 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.494906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4222  hypothetical protein  29.46 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184787  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0622  hypothetical protein  27.83 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3488  hypothetical protein  27.59 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4537  hypothetical protein  25.22 
 
 
119 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4272  hypothetical protein  26.09 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.967441  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5654  hypothetical protein  26.83 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.040863 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4554  hypothetical protein  24.77 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2268  hypothetical protein  24.77 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000109441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>