65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2555 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2555  (dCTP deaminase), deoxycytidine triphosphate deaminase  100 
 
 		 170 aa  353  7.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2556  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.24 
 
 		 224 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0711505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06069  deoxycytidine deaminase  38.46 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06067  hypothetical protein  30.59 
 
 		 172 aa  94.4  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6270  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.66 
 
 		 178 aa  94.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00431284  normal  0.739513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0227  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.97 
 
 		 195 aa  94  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0612  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.73 
 
 		 203 aa  91.3  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2002  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.58 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169741  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2241  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.81 
 
 		 172 aa  85.1  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4349  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.49 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4412  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.92 
 
 		 191 aa  70.9  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491521  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.02 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.96 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.88 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.42 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.42 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3189  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.19 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2112  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.02 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.24843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.42 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6959  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.11 
 
 		 211 aa  64.3  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0459  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.11 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0056  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.92 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38680  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.57 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.52 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0061  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.92 
 
 		 192 aa  62  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.767795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4243  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.07 
 
 		 191 aa  62  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4811  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.17 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4348  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.57 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0448  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.34 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.468429  normal  0.993437 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.07 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.95 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5267  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.49 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.26 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0291  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.52 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.26 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0147  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.07 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0589  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.82 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00611749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0543  dCTP deaminase  30 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.14508  normal  0.0728196 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.82 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1348  dCTP deaminase  25.41 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000358691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0417  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.07 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.429119 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0440  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.07 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.07 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35480  dCTP deaminase  24.73 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3877  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.86 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.82 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.49 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.53 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1302  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.99 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10326  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.97 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0882  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.25 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0216441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.28 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2714  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.41 
 
 		 195 aa  51.6  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1478  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.9 
 
 		 193 aa  51.6  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1008  deoxycytidine triphosphate deaminase  28 
 
 		 185 aa  51.2  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216038  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.65 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1090  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.32 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.1 
 
 		 199 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0767  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.33 
 
 		 187 aa  48.1  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102509  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.95 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.92 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1477  dCTP deaminase  27.22 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.48 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  23.2 
 
 		 182 aa  44.7  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1411  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.24 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.703035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>