13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1501 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1501  fimbrial protein  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3824  fimbrial protein-like protein  40.76 
 
 		 208 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2039  fimbrial protein  37.77 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330404  normal  0.373612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1891  type 1 pili subunit FimI  37.63 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2230  type I pilus biogensis protein FimA  37.2 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1466  fimbrial protein  36.71 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  30.15 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
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NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  30.15 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  30.15 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  30.15 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167394 
 
 
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NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  29.41 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
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NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  28.72 
 
 		 174 aa  47.8  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260678 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  36.92 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
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