30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5186 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0439  hypothetical protein  79.78 
 
 		 462 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4735  GTP-binding protein, HSR1-related  80.04 
 
 		 462 aa  679    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.192614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0331  GTP-binding protein HSR1-related  94.27 
 
 		 454 aa  781    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5363  GTP-binding protein, HSR1-like  83.59 
 
 		 461 aa  664    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5186  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 454 aa  893    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5134  hypothetical protein  97.36 
 
 		 456 aa  779    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5007  GTP-binding protein, HSR1-related  97.36 
 
 		 454 aa  781    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4212  GTP-binding protein, HSR1-related  77.31 
 
 		 455 aa  627  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48140  HSR1-related GTP-binding protein  76.23 
 
 		 447 aa  616  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04510  hypothetical protein  76.44 
 
 		 459 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0437  hypothetical protein  75.33 
 
 		 458 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0149  hypothetical protein  60.88 
 
 		 462 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0511  GTP-binding protein HSR1-related  59.56 
 
 		 462 aa  438  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.886281  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3226  GTP-binding protein HSR1-related  47.59 
 
 		 473 aa  333  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3494  GTP-binding protein, HSR1-related  39.43 
 
 		 464 aa  316  4e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000393129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4059  GTP-binding protein HSR1-related  37.88 
 
 		 454 aa  283  7.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1205  GTP-binding protein, HSR1-related  43.5 
 
 		 520 aa  276  6e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1298  GTP-binding protein, HSR1-related  42.67 
 
 		 538 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1120  hypothetical protein  42.39 
 
 		 524 aa  270  5e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0950  GTP-binding protein, HSR1-related  28.5 
 
 		 467 aa  121  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.892175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0080  hypothetical protein  29.31 
 
 		 476 aa  96.7  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2941  GTP-binding protein HSR1-related  32.11 
 
 		 508 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.781995 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0660  GTP-binding protein HSR1-related  27.09 
 
 		 468 aa  73.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1450  GTP-binding protein HSR1-related  24.74 
 
 		 474 aa  73.9  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1439  hypothetical protein  37.34 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.143053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0956  small GTP-binding protein  40 
 
 		 157 aa  47  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740927  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2733  GTP-binding protein EngA  28.28 
 
 		 494 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf303  GTP-binding protein EngA  36.49 
 
 		 434 aa  44.3  0.004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.778638  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4257  tRNA modification GTPase TrmE  45.31 
 
 		 437 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.910878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  27.39 
 
 		 490 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>