24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4445 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4445  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00317047  hitchhiker  0.000033336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4354  hypothetical protein  89.76 
 
 		 254 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00552535  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1369  hypothetical protein  90.53 
 
 		 243 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1009  putative deacetylase  73.41 
 
 		 254 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00774779  hitchhiker  0.00000000000895825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4433  hypothetical protein  69.01 
 
 		 258 aa  347  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4879  hypothetical protein  66.8 
 
 		 253 aa  327  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56040  hypothetical protein  66.53 
 
 		 253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17920  hypothetical protein  65.16 
 
 		 255 aa  311  6.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00986232  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1223  hypothetical protein  62.35 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3884  hypothetical protein  42.39 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3772  hypothetical protein  42.39 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516985  normal  0.0626785 
 
 
-
 
NC_003296  RS02231  hypothetical protein  43.62 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3284  putative deacetylase  29.92 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0696  deacetylase-like protein  26.22 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1811  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1140  deacetylase-like protein  23.79 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5133  hypothetical protein  29.52 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4939  hypothetical protein  32.17 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4644  hypothetical protein  32.17 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4556  hypothetical protein  32.17 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10799  hypothetical protein  32.85 
 
 		 228 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6882  deacetylase-like protein  32.76 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3616  hypothetical protein  27.92 
 
 		 232 aa  42.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.689056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>