29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4023 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4023  yecA family protein  100 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1394  yecA family protein  98.97 
 
 		 195 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4517  hypothetical protein  98.97 
 
 		 195 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3806  yecA family protein  97.95 
 
 		 195 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  hitchhiker  0.00000393308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1467  YgfB and YecA  87.18 
 
 		 195 aa  345  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1643  hypothetical protein  87.69 
 
 		 195 aa  323  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3739  hypothetical protein  86.67 
 
 		 195 aa  323  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.144928  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3889  hypothetical protein  77.95 
 
 		 195 aa  307  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.370714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45840  hypothetical protein  77.95 
 
 		 195 aa  307  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1811  yecA family protein  80 
 
 		 195 aa  292  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32810  metal-binding protein  79.79 
 
 		 195 aa  252  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.225261  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2227  yecA family protein  42.16 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.802171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0863  YgfB and YecA  39.01 
 
 		 236 aa  125  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1854  hypothetical protein  33.92 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2143  YgfB and YecA  34.91 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1877  yecA family protein  31.38 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2181  hypothetical protein  32.98 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  28.57 
 
 		 432 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0113  yecA family protein  26.97 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000620345  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0645  YecA family protein  26.13 
 
 		 146 aa  51.6  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663243  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  27.07 
 
 		 221 aa  48.1  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0914  yecA family protein  24.87 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  30.53 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  28.57 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2102  yecA family protein  29.03 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  25.47 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.324064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  27.34 
 
 		 249 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  24.58 
 
 		 232 aa  41.6  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  24.58 
 
 		 232 aa  41.6  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>