20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2216 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2216  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  357  5e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.931621  normal  0.927101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1825  hypothetical protein  60.84 
 
 		 172 aa  228  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.668279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0745  hypothetical protein  47.67 
 
 		 183 aa  157  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2502  hypothetical protein  45.12 
 
 		 173 aa  131  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.88856 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5085  hypothetical protein  44.23 
 
 		 177 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.6936 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3519  hypothetical protein  44.23 
 
 		 183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0333839 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3613  hypothetical protein  43.59 
 
 		 173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3907  hypothetical protein  44.23 
 
 		 173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.801532 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5349  hypothetical protein  44.23 
 
 		 180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.570428  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4186  hypothetical protein  42.41 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.210187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2101  hypothetical protein  43.05 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2163  hypothetical protein  41.32 
 
 		 171 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0321  hypothetical protein  44.22 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0426683  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3899  hypothetical protein  35.63 
 
 		 188 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3810  hypothetical protein  33.93 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622372  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  23.58 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0536  hypothetical protein  25.31 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  29.36 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  26.55 
 
 		 145 aa  41.2  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  26.62 
 
 		 161 aa  40.8  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>