17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1191 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1191  bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 		 920 aa  1897    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0184938  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0468  hypothetical protein  33.93 
 
 		 566 aa  286  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  30.6 
 
 		 833 aa  196  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2898  hypothetical protein  25.84 
 
 		 825 aa  71.6  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.523858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2235  hypothetical protein  23.66 
 
 		 526 aa  71.2  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.215413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0602  hypothetical protein  25.49 
 
 		 493 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2457  hypothetical protein  25.63 
 
 		 820 aa  62  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  27.27 
 
 		 771 aa  60.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6918  hypothetical protein  23.98 
 
 		 681 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  26.4 
 
 		 756 aa  55.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  27.02 
 
 		 751 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18136  predicted protein  23.42 
 
 		 724 aa  54.7  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0028227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27548  predicted protein  23.42 
 
 		 689 aa  51.2  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000091689  normal  0.509661 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0403  hypothetical protein  34.48 
 
 		 341 aa  50.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3313  hypothetical protein  21.74 
 
 		 444 aa  50.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011890  Mnod_7767  hypothetical protein  26.51 
 
 		 846 aa  46.2  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1907  hypothetical protein  27.73 
 
 		 485 aa  44.7  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.27137  hitchhiker  0.000000104796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>