16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1251 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1251  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 252 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2031  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  28.45 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1246  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  25.1 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.187515  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1679  hypothetical protein  26.23 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.234807  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  24.3 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0617  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  22.75 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  24.82 
 
 		 270 aa  52  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  24.9 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2036  hypothetical protein  26.8 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1311  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  24.9 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1639  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  23.65 
 
 		 314 aa  49.7  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  21.65 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1368  hypothetical protein  26.88 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0029518  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1092  hypothetical protein  26.9 
 
 		 226 aa  46.2  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0886  hypothetical protein  24.54 
 
 		 239 aa  42.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1366  hypothetical protein  21.77 
 
 		 252 aa  42.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>