295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4648 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008760  Pnap_4648  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
234 aa  482  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.818744  normal  0.900302 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2954  transposase, IS4 family protein  72.48 
 
 
320 aa  332  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168264  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3426  transposase, IS4 family protein  72.48 
 
 
326 aa  332  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3766  transposase, IS4 family protein  72.48 
 
 
326 aa  332  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3367  transposase, IS4 family protein  72.48 
 
 
326 aa  332  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105389  normal  0.324658 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0590  transposase, IS4 family protein  72.48 
 
 
326 aa  332  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.605879  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1459  transposase, IS4 family protein  72.48 
 
 
326 aa  332  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2004  transposase, IS4 family protein  72.48 
 
 
326 aa  332  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.094383  normal  0.686139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3096  transposase, IS4 family protein  72.48 
 
 
326 aa  332  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0728273  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3395  transposase, IS4 family protein  68.04 
 
 
328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1753  transposase, IS4 family protein  68.04 
 
 
327 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.808639  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2927  transposase, IS4 family protein  72.94 
 
 
319 aa  304  7e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5648  transposase IS4 family protein  70.32 
 
 
320 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290904  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2494  transposase, IS4 family protein  65.3 
 
 
320 aa  286  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0455823  decreased coverage  0.00299337 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1557  transposase, IS4 family protein  65.3 
 
 
320 aa  286  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3460  transposase, IS4 family protein  65.3 
 
 
320 aa  286  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2718  transposase, IS4 family protein  64.86 
 
 
330 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00012414  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2295  transposase IS4 family protein  63.93 
 
 
327 aa  271  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0556761  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1704  ISRSO18-transposase protein  62.1 
 
 
321 aa  270  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0125656  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1136  ISRSO18-transposase protein  62.56 
 
 
321 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.835296  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0382  ISRSO18-transposase protein  60.73 
 
 
319 aa  264  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0605  ISRSO18-transposase protein  60.73 
 
 
319 aa  264  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2598  ISRSO18-transposase protein  58.9 
 
 
319 aa  254  8e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  58.72 
 
 
326 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3025  transposase IS4 family protein  58.82 
 
 
326 aa  231  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.965699  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2101  transposase IS4 family protein  58.82 
 
 
326 aa  231  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0909  transposase IS4 family protein  58.82 
 
 
326 aa  231  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  58.82 
 
 
326 aa  231  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1356  transposase, IS4 family protein  56.76 
 
 
327 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02453  IS5 transposase  52.05 
 
 
326 aa  228  9e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0522589  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01747  IS5 transposase  52.05 
 
 
326 aa  228  9e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.548346  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1407  ISPssy transposase or derivative  55.5 
 
 
279 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286806  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3838  transposase, IS4 family protein  51.83 
 
 
326 aa  225  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000231978 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0569  IS5 transposase  52.51 
 
 
326 aa  224  6e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0800  IS5 transposase  52.51 
 
 
326 aa  224  6e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3314  IS5 transposase  53.36 
 
 
326 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2076  IS5 transposase  53.36 
 
 
326 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1124  IS5 transposase  53.36 
 
 
326 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0652  IS5 transposase  53.36 
 
 
326 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0934  IS5 transposase  53.36 
 
 
326 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1856  IS5 transposase  53.36 
 
 
326 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.859503  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0023  IS5 transposase  53.36 
 
 
326 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.938635  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4088  IS5 transposase  53.36 
 
 
326 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0322419  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4726  IS5 transposase  53.36 
 
 
326 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4707  IS5 transposase  53.36 
 
 
326 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0171  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0534  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0780  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0844  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0902  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0903  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1166  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1188  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.584401  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1229  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.520476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1310  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1315  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2008  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2010  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2234  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2324  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000979415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2328  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00380976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2426  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2432  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000860937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2541  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2836  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2887  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00537517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3194  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0837027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3208  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
338 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0135274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3731  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0359746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3963  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038297  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4152  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4253  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4347  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4596  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4643  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4702  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4971  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5428  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.826395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5440  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5556  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5564  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5582  ISPssy, transposase  55.5 
 
 
325 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3892  transposase IS4 family protein  52.91 
 
 
326 aa  223  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4142  IS4 family transposase  53.42 
 
 
326 aa  224  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.282209 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1662  transposase IS4 family protein  52.91 
 
 
326 aa  223  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.627269  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2276  transposase IS4 family protein  52.89 
 
 
326 aa  223  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.540999  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0947  IS5 transposase  52.51 
 
 
326 aa  223  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0642  IS5 transposase  52.91 
 
 
330 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0956986  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2257  IS5 transposase  52.91 
 
 
330 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.705619  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0489  transposase IS4 family protein  52.47 
 
 
326 aa  222  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0714  transposase IS4 family protein  52.47 
 
 
326 aa  222  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1565  transposase IS4 family protein  52.47 
 
 
326 aa  222  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.004757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1627  transposase IS4 family protein  52.47 
 
 
326 aa  222  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0994008  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1816  transposase IS4 family protein  52.47 
 
 
326 aa  222  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2314  transposase IS4 family protein  52.47 
 
 
326 aa  222  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0761785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2619  transposase IS4 family protein  52.47 
 
 
326 aa  222  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2970  transposase IS4 family protein  52.47 
 
 
326 aa  222  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.646128  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3076  transposase IS4 family protein  52.47 
 
 
326 aa  222  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3325  transposase IS4 family protein  52.47 
 
 
326 aa  222  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3107  transposase IS4 family protein  52.47 
 
 
326 aa  222  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>