175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4644 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008760  Pnap_4644  stress protein  100 
 
 
427 aa  867    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125989  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0946  tellurium resistance protein, putative  42.08 
 
 
412 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2136  stress protein  41.58 
 
 
431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.312276  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2192  stress protein  32.48 
 
 
437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0544728  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0263  stress protein  30.32 
 
 
413 aa  213  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4663  stress protein  41.62 
 
 
404 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.298991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  39.29 
 
 
532 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  37.14 
 
 
453 aa  133  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3695  Tellurium resistance  36.77 
 
 
384 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00168572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2992  stress protein  29.39 
 
 
432 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000268445  normal  0.372941 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5506  hypothetical protein  28.92 
 
 
248 aa  98.2  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491224  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3876  stress protein  37.59 
 
 
394 aa  96.3  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000202647  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  32.98 
 
 
192 aa  96.3  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3788  tellurite resistance protein  37.59 
 
 
394 aa  96.3  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000690158  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1351  TerA  36.6 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000447285  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0663  tellurite resistance protein  37.59 
 
 
394 aa  96.3  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000164398  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0378  TerD family tellurium resistance protein  32.8 
 
 
192 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0937193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0445  tellurium resistance protein  32.8 
 
 
192 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  32.8 
 
 
192 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0387  tellurium resistance protein  32.46 
 
 
194 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000558292  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  32.98 
 
 
192 aa  94  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  32.98 
 
 
192 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0401  tellurium resistance protein  32.46 
 
 
194 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  32.28 
 
 
192 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  33.16 
 
 
191 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0634  stress response protein  32.43 
 
 
248 aa  93.6  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3872  stress protein  33.16 
 
 
191 aa  93.6  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  33.16 
 
 
191 aa  93.6  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  30.32 
 
 
192 aa  93.2  9e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  32.45 
 
 
192 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  33.33 
 
 
191 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  30.69 
 
 
192 aa  90.5  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  30 
 
 
194 aa  90.5  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  30.73 
 
 
196 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  30.73 
 
 
196 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  30.73 
 
 
196 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  30.73 
 
 
194 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  30.73 
 
 
194 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  30.21 
 
 
194 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  30.21 
 
 
194 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  30.21 
 
 
194 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  29.69 
 
 
194 aa  87  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  31.15 
 
 
191 aa  87  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3020  stress protein  30.32 
 
 
191 aa  87  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  29.26 
 
 
192 aa  86.7  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  29.69 
 
 
194 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2575  stress protein, tellurium resistance protein  29.57 
 
 
191 aa  86.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0760  tellurium resistance protein  27.57 
 
 
419 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0966858  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  34.23 
 
 
192 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  31.55 
 
 
191 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  30.6 
 
 
191 aa  84  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  33.56 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  29.26 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  30.85 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5062  stress protein  27.87 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.416772 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  29.95 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0892  stress protein  29.22 
 
 
418 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  28.88 
 
 
192 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0763  stress protein  30.68 
 
 
427 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  31.37 
 
 
191 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3699  stress protein  31.55 
 
 
191 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  29.41 
 
 
222 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0338  stress protein  31.31 
 
 
192 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  33.56 
 
 
191 aa  82.4  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  30.32 
 
 
191 aa  82  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5063  stress protein  28.34 
 
 
191 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  27.27 
 
 
192 aa  81.3  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0577  stress protein  28.04 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.93235 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  32.89 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0872  tellurium resistance protein  25.2 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2005  stress protein, tellurium resistance protein TerD  31.28 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.432333  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  30.85 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  30.85 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  30.85 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  28.19 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  31.33 
 
 
449 aa  79.7  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2078  stress protein  28.04 
 
 
192 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0926  tellurium resistance protein  25 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1600  stress protein  28.42 
 
 
186 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0707  stress protein  26.2 
 
 
190 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0378  stress protein, tellurium resistance TerD  33.79 
 
 
428 aa  79  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  27.96 
 
 
192 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1095  putative tellurium resistance protein  25.32 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0080  stress protein  29.34 
 
 
412 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1002  stress protein  26.74 
 
 
192 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113516  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2988  stress protein  32.78 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.186461 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4655  stress protein  32.21 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117169  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2122  stress protein  27.51 
 
 
192 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0739458  normal  0.468561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  26.6 
 
 
191 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0269  stress protein  33.99 
 
 
192 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.394483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0263  stress protein  29.33 
 
 
194 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2120  stress protein  28.11 
 
 
192 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.660926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  28.34 
 
 
191 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2076  stress protein  28.11 
 
 
192 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  28.88 
 
 
191 aa  75.1  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  28.88 
 
 
191 aa  75.1  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  26.06 
 
 
191 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  29.63 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  27.13 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3376  hypothetical protein  27.35 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.286986 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>