26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2563 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2563  periplasmic lipoprotein-like protein  100 
 
 		 369 aa  731    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440484  hitchhiker  0.00108015 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1923  periplasmic lipoprotein-like protein  57.93 
 
 		 375 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.576984  hitchhiker  0.00344401 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1460  periplasmic lipolike protein  60.57 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0139053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1527  periplasmic lipoprotein-like protein  48.51 
 
 		 361 aa  279  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  27.35 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  24.86 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1802  hypothetical protein  22.83 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  26.07 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  23.05 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  24.2 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  27.41 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1784  putative lipoprotein  23.34 
 
 		 339 aa  51.2  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  25.23 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  21.66 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403933 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003125  iron-regulated protein A precursor  22.99 
 
 		 345 aa  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392653  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  25.45 
 
 		 366 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02712  hypothetical protein  25.25 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  26.83 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  21.74 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  26.83 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0195  putative signal peptide protein  26.39 
 
 		 329 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0641  hypothetical protein  24.74 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  23.85 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  25.84 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4368  lipoprotein, putative  24.26 
 
 		 354 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2203  hypothetical protein  25.42 
 
 		 342 aa  42.7  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>