38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0710 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0710  ribosomal protein L35  100 
 
 
70 aa  136  8.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0924  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 
72 aa  53.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000127679  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0661  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
67 aa  52  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  46.03 
 
 
64 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
64 aa  50.8  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6086  50S ribosomal protein L35P  54.17 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1254  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00450085  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  42.86 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  46.03 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1202  50S ribosomal protein L35  45 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750634  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
64 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12260  LSU ribosomal protein L35P  46.03 
 
 
64 aa  47  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162562  normal  0.135462 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
64 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  42.86 
 
 
64 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21900  LSU ribosomal protein L35P  41.27 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404594  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1313  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.711955  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  42.86 
 
 
64 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3053  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1677  ribosomal protein L35  39.68 
 
 
65 aa  44.3  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0163169  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  42.86 
 
 
63 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1883  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0659918  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  41.27 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  39.68 
 
 
64 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1876  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.322523 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0174  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 
64 aa  41.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  43.55 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  38.71 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  42.86 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  36.92 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1713  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.971881  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0214  ribosomal protein L35  58.82 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0660989  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.503383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>