22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4145 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4145  TM2 domain-containing protein  100 
 
 		 132 aa  262  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5043  hypothetical protein  84.62 
 
 		 184 aa  234  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0480  TM2  83.08 
 
 		 134 aa  228  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.748725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0374  TM2 domain-containing protein  83.59 
 
 		 139 aa  223  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0167  TM2 domain-containing protein  85.16 
 
 		 135 aa  223  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5316  TM2  79.23 
 
 		 144 aa  222  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5091  hypothetical protein  83.72 
 
 		 139 aa  222  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4964  TM2 domain-containing protein  82.17 
 
 		 139 aa  219  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5141  TM2 domain-containing protein  81.4 
 
 		 139 aa  219  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05210  hypothetical protein  81.54 
 
 		 134 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0498  hypothetical protein  80 
 
 		 134 aa  216  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03100  TM2 domain-containing hypothetical protein  86.36 
 
 		 133 aa  209  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1993  TM2 domain-containing protein  73.64 
 
 		 135 aa  203  7e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0383529  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0299  TM2 domain containing protein  73.44 
 
 		 135 aa  200  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000251621  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1622  hypothetical protein  69.53 
 
 		 132 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2502  TM2  79.07 
 
 		 140 aa  189  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000265771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4937  TM2 domain containing protein  42.42 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2399  TM2 domain-containing protein  54.1 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324538  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0479  TM2 domain-containing protein  40.7 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4957  TM2  41.89 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1825  TM2 domain containing protein  48.21 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  51.43 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>