76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3087 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3087  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  100 
 
 		 175 aa  353  8.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.445171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3355  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  62.67 
 
 		 152 aa  184  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1824  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  63.33 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3159  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  62 
 
 		 152 aa  181  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0921004  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6035  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  61.38 
 
 		 163 aa  177  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1840  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  56.67 
 
 		 158 aa  171  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.498361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3943  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  57.43 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.274484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4311  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  56.76 
 
 		 182 aa  164  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0626  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  54.86 
 
 		 152 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707328  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1523  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  55.7 
 
 		 199 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404743 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2612  GCN5-related N-acetyltransferase  37.75 
 
 		 148 aa  90.9  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  0.492654 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0641  acetyltransferase  35.77 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000036985  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  31.16 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2551  GCN5-related N-acetyltransferase  36.27 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3585  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.73 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  30.69 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  27.52 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4874  GCN5-related N-acetyltransferase  33.7 
 
 		 140 aa  51.6  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1753  hypothetical protein  31.19 
 
 		 154 aa  50.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.86 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  32.2 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.631657  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17770  acetyltransferase  32.14 
 
 		 157 aa  47.8  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356632 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1190  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.68 
 
 		 181 aa  47.4  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00870  hypothetical protein  39.68 
 
 		 243 aa  47  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0836  GCN5-related N-acetyltransferase  25.23 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.88 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.380338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1403  GCN5-related N-acetyltransferase  40.98 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0574553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0813  putative acetyltransferase  39.68 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.425962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  28.83 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3759  GCN5-related protein N-acetyltransferase  26.47 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.875484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3737  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.55 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0358  GCN5-related N-acetyltransferase  23.81 
 
 		 149 aa  45.1  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1057  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 		 149 aa  45.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2689  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 		 151 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.53 
 
 		 161 aa  44.3  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4510  GCN5-related N-acetyltransferase  32.73 
 
 		 204 aa  44.3  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0032578  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0145  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.52 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1293  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.35 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.489062  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0119  acetyltransferase  27.05 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001601  acetyltransferase  28.79 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2681  GCN5-related N-acetyltransferase  32.11 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.675647  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0028  GCN5-related N-acetyltransferase  30.33 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.578829 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2560  acetyltransferase  30.86 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.87782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3124  acetyltransferase, GNAT family  29.41 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0505019  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1290  GCN5-related N-acetyltransferase  23.53 
 
 		 364 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3427  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0801  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.74 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  26.42 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406329  normal  0.262902 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2926  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 		 141 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.834032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.43 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6551  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 178 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000160944  normal  0.118655 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46090  predicted protein  32.2 
 
 		 282 aa  42.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0374  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 		 155 aa  42  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.918937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3537  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 		 268 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 		 153 aa  42  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0769  GCN5-related N-acetyltransferase  38.98 
 
 		 277 aa  41.6  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3462  putative acetyltransferase  31.58 
 
 		 141 aa  41.6  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12798  acetyltransferase, GNAT family protein  25.66 
 
 		 149 aa  41.2  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0029  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.63 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1265  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 		 204 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1296  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 		 204 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  22.95 
 
 		 143 aa  41.2  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3969  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 		 153 aa  41.2  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0433  acetyltransferase  28.3 
 
 		 165 aa  41.2  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  26.12 
 
 		 381 aa  41.2  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  26.98 
 
 		 911 aa  40.8  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  30.93 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0339934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4155  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 186 aa  40.8  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481727  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0593  putative acetyltransferase  26.53 
 
 		 153 aa  40.8  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.623078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0003  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 		 320 aa  40.8  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1878  GCN5-related N-acetyltransferase  23.93 
 
 		 161 aa  40.8  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0723  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 		 244 aa  40.8  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2184  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 		 148 aa  40.8  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.553749  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>