21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2687 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2687  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  536  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0951528  normal  0.504159 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3565  extracellular solute-binding protein  49.38 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1833  hypothetical protein  47.37 
 
 		 279 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3943  periplasmic binding protein  48.93 
 
 		 277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4246  periplasmic binding protein  46.03 
 
 		 266 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1622  extracellular solute-binding protein  45.45 
 
 		 266 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.12881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2686  extracellular solute-binding protein  45.27 
 
 		 263 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0129689  normal  0.492762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2024  hypothetical protein  50 
 
 		 279 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3812  extracellular solute-binding protein  44.98 
 
 		 266 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2113  hypothetical protein  36.4 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.018771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1473  hypothetical protein  37.3 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1618  hypothetical protein  34.9 
 
 		 268 aa  172  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1839  hypothetical protein  36.44 
 
 		 275 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1878  amino acid ABC transporter periplasmic protein  38.22 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.201916  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1854  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.549839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1807  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2471  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.519475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1815  hypothetical protein  32.48 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1194  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.71 
 
 		 281 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0931716  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3744  chorismate mutase, putative  25.69 
 
 		 421 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117732  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  23.77 
 
 		 252 aa  42.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>