23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2271 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2271  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  147  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0912556  hitchhiker  0.00147123 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2428  hypothetical protein  61.84 
 
 		 77 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0557927  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3971  hypothetical protein  65.71 
 
 		 77 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.12122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2985  hypothetical protein  64.47 
 
 		 77 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.327676  normal  0.403692 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3134  hypothetical protein  47.76 
 
 		 69 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1446  hypothetical protein  57.14 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1415  hypothetical protein  46.43 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3873  hypothetical protein  46.43 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0534679  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1837  hypothetical protein  46.43 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42710  hypothetical protein  48 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1259  hypothetical protein  51.92 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2919  hypothetical protein  51.92 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3848  hypothetical protein  45.83 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0790334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23810  hypothetical protein  45.1 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2697  hypothetical protein  48.08 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1982  hypothetical protein  45.45 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2624  hypothetical protein  40.43 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4546  hypothetical protein  30.14 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.195637  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2789  hypothetical protein  36.73 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1461  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802957  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3511  hypothetical protein  44.68 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.573232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3586  hypothetical protein  51.02 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1550  hypothetical protein  54.17 
 
 		 60 aa  41.2  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>