41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2264 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2264  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  267  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124319  normal  0.0478819 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11150  hypothetical protein  44.85 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0562  hypothetical protein  32.84 
 
 		 168 aa  73.6  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3667  hypothetical protein  40.18 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290827  normal  0.787143 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3100  hypothetical protein  36.03 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3827  hypothetical protein  36.03 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.78759  normal  0.497757 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01473  predicted membrane protein i A1501  34.17 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0158  hypothetical protein  33.09 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3847  hypothetical protein  38 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2312  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  28.85 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  32.63 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  28.85 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  29.81 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  28.85 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3572  hypothetical protein  26.17 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  23.71 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  28.85 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  28.28 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  26.92 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  28.42 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  24.77 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  28.43 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  27.45 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  28.7 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  23.85 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  27.37 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  27.37 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  28.78 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  28.7 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  27.37 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  29.63 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  27.78 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3754  hypothetical protein  25 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3443  hypothetical protein  26.53 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  23.78 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09781  hypothetical protein  23.33 
 
 		 188 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.711198  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0919  hypothetical protein  22.94 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.113823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  26.67 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09801  hypothetical protein  25 
 
 		 188 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  28.12 
 
 		 136 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>