17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2126 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2126  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 109 aa  224  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  0.081563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63450  hypothetical protein  69.72 
 
 		 111 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2653  hypothetical protein  66.06 
 
 		 111 aa  165  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  68.22 
 
 		 111 aa  163  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2937  plasmid stabilization system  65.05 
 
 		 106 aa  156  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5159  plasmid stabilization system protein  62.39 
 
 		 109 aa  154  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6480  hypothetical protein  48.68 
 
 		 81 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.834364 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3567  plasmid stabilization system protein  38.53 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1660  hypothetical protein  34.34 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.067401  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  34.31 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  34.12 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  32.05 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  32.1 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  32.1 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  34.88 
 
 		 97 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  25.81 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  24.53 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>