43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1272 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1272  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  589  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1189  hypothetical protein  71.13 
 
 
291 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0801  protein of unknown function DUF125 transmembrane  72.16 
 
 
291 aa  455  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1572  protein of unknown function DUF125 transmembrane  73.36 
 
 
291 aa  450  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.493606  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1070  hypothetical protein  70.73 
 
 
292 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0912  protein of unknown function DUF125 transmembrane  64.6 
 
 
291 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1196  protein of unknown function DUF125 transmembrane  63.8 
 
 
285 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0438  hypothetical protein  54.58 
 
 
284 aa  295  6e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0423  hypothetical protein  54.58 
 
 
284 aa  295  6e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1809  hypothetical protein  47.86 
 
 
288 aa  281  9e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.305818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1514  hypothetical protein  48.8 
 
 
292 aa  279  4e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671391  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1653  hypothetical protein  51.6 
 
 
291 aa  275  5e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.850435  normal  0.0303841 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0215  protein of unknown function DUF125 transmembrane  46.29 
 
 
300 aa  265  5.999999999999999e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1685  protein of unknown function DUF125 transmembrane  47.48 
 
 
289 aa  260  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0860  hypothetical protein  47.48 
 
 
293 aa  259  4e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.110107  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01890  uncharacterized membrane protein  49.49 
 
 
297 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1173  protein of unknown function DUF125 transmembrane  44.44 
 
 
293 aa  248  9e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1049  hypothetical protein  43.51 
 
 
293 aa  221  9.999999999999999e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2800  protein of unknown function DUF125 transmembrane  43.77 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.792813  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0331  hypothetical protein  38.04 
 
 
287 aa  211  1e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.464299  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0496  hypothetical protein  36.01 
 
 
299 aa  155  9e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0704  hypothetical protein  35.46 
 
 
299 aa  152  8e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.258152  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1758  hypothetical protein  34.88 
 
 
297 aa  148  8e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0216697  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0774  hypothetical protein  34.52 
 
 
297 aa  144  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.443952 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1650  hypothetical protein  31.69 
 
 
290 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.381623  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0835  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.64 
 
 
358 aa  103  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1094  hypothetical protein  31.82 
 
 
374 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0379  hypothetical protein  23.8 
 
 
362 aa  82.4  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0378  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.5 
 
 
352 aa  79  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0516728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1468  protein of unknown function DUF125 transmembrane  29 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181021  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  30.93 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  28.8 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0522  hypothetical protein  24.59 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.655797  normal  0.060241 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  28.43 
 
 
365 aa  60.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.14 
 
 
360 aa  60.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  27.72 
 
 
387 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.63 
 
 
396 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3216  protein of unknown function DUF125 transmembrane  29.53 
 
 
389 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000032928 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0161  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.5 
 
 
399 aa  50.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279325  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.26 
 
 
401 aa  47.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.171497  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1689  hypothetical protein  29.03 
 
 
383 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37632  predicted protein  31.91 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  38.1 
 
 
232 aa  43.9  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>